More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1638 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1638  exonuclease III  100 
 
 
268 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1668  exonuclease III  92.51 
 
 
268 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000408122  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2927  exonuclease III  91.39 
 
 
268 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2262  exonuclease III  89.14 
 
 
269 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000598983  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1513  exonuclease III  87.64 
 
 
270 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00343054  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3037  exonuclease III  86.89 
 
 
270 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2737  exonuclease III  87.64 
 
 
270 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000050651  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1649  exonuclease III  87.64 
 
 
270 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000202985  hitchhiker  0.0000000000656111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2816  exonuclease III  87.27 
 
 
270 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000137718  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1447  exonuclease III  87.27 
 
 
270 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2715  exonuclease III  87.64 
 
 
270 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000224276  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2418  exonuclease III  85.77 
 
 
270 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1503  exonuclease III  85.77 
 
 
270 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1465  exonuclease III  83.96 
 
 
269 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00148193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1420  exonuclease III  82.09 
 
 
268 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.608481  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01553  exonuclease III  77.24 
 
 
268 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003967  exodeoxyribonuclease III  76.03 
 
 
268 aa  447  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000103891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3173  exonuclease III  76.12 
 
 
268 aa  444  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1451  exonuclease III  72.66 
 
 
268 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000170984  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1962  exonuclease III  71.16 
 
 
268 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2648  exodeoxyribonuclease III  70.79 
 
 
269 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02430  exodeoxyribonuclease III  68.91 
 
 
269 aa  407  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.977241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1319  exodeoxyribonuclease III  69.03 
 
 
269 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2139  exodeoxyribonuclease III  73.03 
 
 
268 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1974  exonuclease III  63.06 
 
 
272 aa  381  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2270  exonuclease III  64.18 
 
 
272 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2692  exonuclease III  65.04 
 
 
270 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31650  exonuclease III  64.29 
 
 
270 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2890  exonuclease III  62.96 
 
 
270 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00987023  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2393  exonuclease III  63.33 
 
 
270 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7029  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2366  exodeoxyribonuclease III  65.56 
 
 
289 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762147  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2800  exonuclease III  63.33 
 
 
270 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2747  exodeoxyribonuclease III  62.22 
 
 
270 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614534  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1396  exonuclease III  62.17 
 
 
268 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0639091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1413  exonuclease III  62.17 
 
 
268 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1429  exonuclease III  62.17 
 
 
268 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2436  exonuclease III  64.29 
 
 
270 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.677359  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2044  exonuclease III  62.17 
 
 
268 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1873  exonuclease III  62.17 
 
 
268 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2206  exodeoxyribonuclease III  61.94 
 
 
268 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3649  exonuclease III  62.59 
 
 
270 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2085  exonuclease III  62.69 
 
 
268 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2892  exonuclease III  62.22 
 
 
270 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0279312  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1976  exonuclease III  62.69 
 
 
268 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000370761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1964  exodeoxyribonuclease III  62.69 
 
 
268 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2715  exonuclease III  61.94 
 
 
268 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.946533  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2340  exonuclease III  62.69 
 
 
268 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518305  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1695  exonuclease III  62.17 
 
 
268 aa  363  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2476  exonuclease III  61.11 
 
 
270 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1362  normal  0.165238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1893  exodeoxyribonuclease III  61.42 
 
 
272 aa  360  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0788201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2468  exonuclease III  61.42 
 
 
268 aa  360  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.906333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1883  exonuclease III  61.42 
 
 
272 aa  360  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01718  exonuclease III  61.42 
 
 
268 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1972  exonuclease III  61.42 
 
 
268 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1833  exonuclease III  61.42 
 
 
268 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01706  hypothetical protein  61.42 
 
 
268 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1997  exonuclease III  61.42 
 
 
268 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.892579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1441  exonuclease III  61.05 
 
 
268 aa  358  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28880  exonuclease III  61.28 
 
 
270 aa  358  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.734088  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1621  exodeoxyribonuclease III  58.15 
 
 
276 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000939978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0836  exonuclease III  58.21 
 
 
267 aa  339  2.9999999999999998e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.337185  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2052  exonuclease III  60.89 
 
 
273 aa  338  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2379  exonuclease III  56.93 
 
 
276 aa  335  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.88562e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1490  exodeoxyribonuclease III  56.13 
 
 
270 aa  328  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1995  exonuclease III  56.46 
 
 
272 aa  326  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297958  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1539  exonuclease III  56.02 
 
 
271 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.493203  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1192  exonuclease III  56.72 
 
 
274 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166558  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1637  exonuclease III  53.38 
 
 
270 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00257363  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1199  exonuclease III  55.6 
 
 
274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.712214  normal  0.0221694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1258  exonuclease III  54.85 
 
 
271 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000275406  normal  0.0123433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  41.26 
 
 
255 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  39.77 
 
 
255 aa  175  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  37.08 
 
 
267 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  35.82 
 
 
279 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  36.74 
 
 
277 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  38.95 
 
 
264 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  35.96 
 
 
263 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  35.82 
 
 
264 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 
260 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  35.82 
 
 
260 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  38.26 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  35.96 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  35.96 
 
 
265 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  36.94 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  34.46 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  35.71 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  36.53 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  35.98 
 
 
261 aa  161  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  36.12 
 
 
262 aa  161  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  35.45 
 
 
263 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  37.55 
 
 
254 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  35.21 
 
 
263 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  36.06 
 
 
262 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  38.38 
 
 
258 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  36.84 
 
 
265 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  35.23 
 
 
266 aa  158  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  34.59 
 
 
270 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  37.22 
 
 
265 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  34.09 
 
 
256 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  35.47 
 
 
261 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>