More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0792 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.58 
 
 
1040 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0792  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 
1027 aa  2071    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00116886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  34.18 
 
 
1028 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.73 
 
 
1032 aa  675    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  38.28 
 
 
1063 aa  722    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.15 
 
 
1043 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  35.74 
 
 
1056 aa  675    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  39.38 
 
 
1050 aa  742    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  35.69 
 
 
1032 aa  642    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  37.75 
 
 
1079 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  36.91 
 
 
1083 aa  720    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.35 
 
 
1031 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.08 
 
 
1054 aa  753    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.96 
 
 
1056 aa  683    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  39.44 
 
 
1040 aa  740    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.5 
 
 
1055 aa  744    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1612  acriflavin resistance protein  43.31 
 
 
1010 aa  875    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.35 
 
 
1031 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.02 
 
 
1040 aa  736    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  37.77 
 
 
1029 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.46 
 
 
1039 aa  707    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.5 
 
 
1055 aa  743    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  36.63 
 
 
1025 aa  663    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.08 
 
 
1054 aa  753    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  39.38 
 
 
1050 aa  777    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  39.81 
 
 
1045 aa  764    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  35.31 
 
 
1027 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.74 
 
 
1056 aa  675    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  37.21 
 
 
1049 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  37.58 
 
 
1040 aa  722    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  33.97 
 
 
1032 aa  635  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.82 
 
 
1037 aa  630  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  34.81 
 
 
1033 aa  625  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  34.44 
 
 
1019 aa  625  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.49 
 
 
1038 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.46 
 
 
1031 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  34.73 
 
 
1021 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  33.82 
 
 
1033 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.27 
 
 
1046 aa  602  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  32.53 
 
 
1034 aa  605  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  34.95 
 
 
1029 aa  602  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  33.94 
 
 
1036 aa  598  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.19 
 
 
1025 aa  595  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  34.37 
 
 
1039 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.37 
 
 
1049 aa  588  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.04 
 
 
1040 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  32.56 
 
 
1033 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.56 
 
 
1051 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.88 
 
 
1042 aa  568  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  32.51 
 
 
1038 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.95 
 
 
1047 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  34.13 
 
 
1032 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  32.46 
 
 
1047 aa  558  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  33.04 
 
 
1032 aa  556  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  31.15 
 
 
1030 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  31.81 
 
 
1039 aa  555  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.08 
 
 
1060 aa  554  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  32.06 
 
 
1049 aa  552  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.96 
 
 
1052 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  30.71 
 
 
1032 aa  549  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  32.29 
 
 
1064 aa  548  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  31.53 
 
 
1083 aa  548  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0687  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.42 
 
 
1033 aa  547  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0323863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  31.36 
 
 
1034 aa  549  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  33.76 
 
 
1032 aa  544  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  32.18 
 
 
1059 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  32 
 
 
1050 aa  545  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.3 
 
 
1034 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.56 
 
 
1034 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  31.48 
 
 
1083 aa  546  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  31.28 
 
 
1069 aa  545  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  31.75 
 
 
1079 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  31.81 
 
 
1034 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  32.54 
 
 
1054 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1080  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.37 
 
 
1051 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114839  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  32.16 
 
 
1052 aa  542  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  32.1 
 
 
1032 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  32.54 
 
 
1077 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5137  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.37 
 
 
1079 aa  539  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.858708  normal  0.481716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  32.91 
 
 
1034 aa  535  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.76 
 
 
1063 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  31.75 
 
 
1077 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  31.64 
 
 
1077 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  32.2 
 
 
1034 aa  536  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  30.78 
 
 
1062 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  31.55 
 
 
1077 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  31.55 
 
 
1077 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  31.55 
 
 
1077 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  31.64 
 
 
1077 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  31.46 
 
 
1077 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  31.5 
 
 
1070 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  32.67 
 
 
1063 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  32.39 
 
 
1053 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  30.96 
 
 
1070 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  30.85 
 
 
1045 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.77 
 
 
1458 aa  529  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  30.26 
 
 
1065 aa  526  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.81 
 
 
1034 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  32.39 
 
 
1053 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  30.96 
 
 
1070 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
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