90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0665 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0665  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 452 aa  915    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.020482  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  31.56 
 
 		 2145 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1238 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  32.42 
 
 		 782 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  28.8 
 
 		 985 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 		 991 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 1060 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.22 
 
 		 828 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1101 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 1313 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.62 
 
 		 1228 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1550 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 1063 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  31.5 
 
 		 650 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  27.08 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 852 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  24.58 
 
 		 844 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 760 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 1261 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 571 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  27.86 
 
 		 1040 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  24.76 
 
 		 1180 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  27.49 
 
 		 816 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1285 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  27.74 
 
 		 621 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 949 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  29.53 
 
 		 694 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  22.22 
 
 		 1914 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.23 
 
 		 560 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 923 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  30.15 
 
 		 957 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1444  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 181 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.83 
 
 		 809 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  29.53 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  21.79 
 
 		 775 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  25.09 
 
 		 1147 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3508  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.86 
 
 		 1295 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  30.99 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 771 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3010  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122789  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  26.8 
 
 		 689 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1025 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.25 
 
 		 609 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  29.23 
 
 		 991 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 659 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1526 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1404 aa  47.4  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 		 779 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3522  diguanylate cyclase  28.81 
 
 		 636 aa  47  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.890826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 730 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 		 1153 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 809 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0132  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 267 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 565 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  30.77 
 
 		 977 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 209 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 847 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  24.11 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 799 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42809  predicted protein  27.81 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767843  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  24.44 
 
 		 999 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1714 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  26.19 
 
 		 1009 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 288 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  22.58 
 
 		 934 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 700 aa  44.3  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.55 
 
 		 1266 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 833 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 714 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1091 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1149  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 613 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0760  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 800 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0281555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  21.99 
 
 		 992 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2664  putative PAS/PAC sensor protein  26.72 
 
 		 695 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.228466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3123  hypothetical protein  31 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  25.12 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  25.91 
 
 		 340 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  22.67 
 
 		 965 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  25.12 
 
 		 388 aa  43.5  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  26.24 
 
 		 836 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 263 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  28.68 
 
 		 1004 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  24.88 
 
 		 671 aa  43.1  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  19.15 
 
 		 1298 aa  43.1  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>