41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3123 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3123  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  754    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3127  glycosyl transferase family 2  54.34 
 
 
365 aa  401  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1645  hypothetical protein  46.24 
 
 
416 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3126  hypothetical protein  95.24 
 
 
126 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3122  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.46 
 
 
516 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1036  hypothetical protein  56.94 
 
 
98 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1288  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895631  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8532  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000714646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0888  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1556  glycosyl transferase family 2  23.41 
 
 
659 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.692069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
797 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1128  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
640 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1266  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
563 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
677 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5089  glycosyl transferase family protein  23.12 
 
 
562 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.174654  normal  0.203443 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
392 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
392 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  29.13 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  20.7 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0323  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00034223  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0383  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
667 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.542289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1118  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 
365 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1666  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
404 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
826 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1402  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
646 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  24.17 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0515  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
857 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
632 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1401  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
798 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5618  family 2 glycosyl transferase  22.47 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
256 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1511  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
359 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.675878  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0665  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 
452 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.020482  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
255 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1477  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
877 aa  43.5  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
255 aa  42.7  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  27.71 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>