146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1556 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1556  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
659 aa  1306    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.692069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4876  methyltransferase FkbM family  54.35 
 
 
931 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3495  glycosyl transferase family protein  57.23 
 
 
661 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5073  glycosyl transferase family 2  49.86 
 
 
369 aa  319  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456555  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0383  glycosyl transferase family protein  47.61 
 
 
667 aa  308  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.542289  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0575  glycosyl transferase family protein  48.03 
 
 
384 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1288  glycosyl transferase family protein  41.32 
 
 
379 aa  219  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895631  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5089  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 
562 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.174654  normal  0.203443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5052  glycosyl transferase family 2  41.42 
 
 
897 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00429729  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1266  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 
563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8532  glycosyl transferase family 2  37.94 
 
 
404 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000714646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3707  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
371 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647208  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5618  family 2 glycosyl transferase  36.49 
 
 
356 aa  183  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0088  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
250 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1666  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
404 aa  150  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1294  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 
719 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2054  glycosyltransferase  30.68 
 
 
406 aa  140  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2384  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.68 
 
 
406 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.330262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2120  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.68 
 
 
406 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2058  glycosyltransferase  30.68 
 
 
406 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0045842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2274  group 2 family glycosyl transferase  30.68 
 
 
406 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2300  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.68 
 
 
406 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000740458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2306  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.14 
 
 
406 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.416801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2257  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.86 
 
 
406 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3068  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.32 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.670881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3845  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
385 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0933  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
364 aa  94.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1105  glycosyltransferase  28.82 
 
 
365 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1331  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 
366 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1369  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 
366 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1131  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.47 
 
 
370 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1111  glycosyltransferase  28.47 
 
 
366 aa  92.8  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1224  group 2 family glycosyl transferase  28.47 
 
 
370 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.47 
 
 
366 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0409043 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4078  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 
365 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1263  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 
365 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1118  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
365 aa  90.5  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0772  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
359 aa  90.1  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0888  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
363 aa  89  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2023  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0939  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
391 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.709084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2810  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
356 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
826 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 
1162 aa  73.9  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
363 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
677 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0171  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 
860 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1401  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
798 aa  68.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1695  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  37.5 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
585 aa  68.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1812  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
875 aa  67.4  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.515485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
1435 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2509  hypothetical protein  28.32 
 
 
354 aa  66.6  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0323  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
341 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00034223  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0506  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
259 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 
797 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1388  glycosyl transferase family protein  25.92 
 
 
421 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1386  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
657 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0169  glycosyl transferase family protein  22.98 
 
 
860 aa  64.7  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2559  glycosyl transferase family 2  40.68 
 
 
754 aa  64.3  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2521  glycosyl transferase family 2  43.3 
 
 
444 aa  64.7  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00644687  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0270  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
397 aa  64.3  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1477  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
877 aa  64.3  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2617  glycosyl transferase family 2  43.3 
 
 
444 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000160485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
1268 aa  63.9  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1337  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 
438 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00375711  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0515  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
857 aa  63.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 
521 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  40.62 
 
 
427 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  27.07 
 
 
260 aa  60.8  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1372  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
633 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  27.07 
 
 
260 aa  60.8  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  33.49 
 
 
362 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1578  glycosyl transferase  26.83 
 
 
183 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0848772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1402  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 
646 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
640 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  40.86 
 
 
291 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
396 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0981  beta 1,4 glucosyltransferase  40.86 
 
 
291 aa  58.9  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0220  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
608 aa  58.9  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
535 aa  58.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 
397 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1385  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
377 aa  57.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1128  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 
414 aa  57.4  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 
1523 aa  57.4  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
395 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
256 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
255 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
400 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  43.16 
 
 
400 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 
1523 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3123  hypothetical protein  23.01 
 
 
362 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
253 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
392 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0802  glycosyl transferase family 2  47.83 
 
 
386 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  25.82 
 
 
259 aa  55.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
392 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
260 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
263 aa  54.3  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>