140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3707 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3707  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
371 aa  772    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647208  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5089  glycosyl transferase family protein  42.98 
 
 
562 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.174654  normal  0.203443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1266  glycosyl transferase family protein  40.87 
 
 
563 aa  259  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8532  glycosyl transferase family 2  39.52 
 
 
404 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000714646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5052  glycosyl transferase family 2  40.54 
 
 
897 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00429729  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4876  methyltransferase FkbM family  36.93 
 
 
931 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3495  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 
661 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2257  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.34 
 
 
406 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3068  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.09 
 
 
406 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.670881 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2306  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.84 
 
 
406 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.416801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1288  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 
379 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895631  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5073  glycosyl transferase family 2  36.31 
 
 
369 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456555  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2384  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.34 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.330262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2054  glycosyltransferase  36.34 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2120  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.34 
 
 
406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2058  glycosyltransferase  36.34 
 
 
406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0045842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2274  group 2 family glycosyl transferase  36.34 
 
 
406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2300  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.34 
 
 
406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000740458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5618  family 2 glycosyl transferase  37.36 
 
 
356 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1666  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
404 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0575  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0383  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
667 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.542289  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1556  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
659 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.692069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1294  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
719 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1118  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
365 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4078  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.2 
 
 
365 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0888  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1131  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.49 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1111  glycosyltransferase  24.49 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1224  group 2 family glycosyl transferase  24.49 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1695  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.49 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0409043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1331  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.91 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1369  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.91 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1263  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.32 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1105  glycosyltransferase  23.62 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0772  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0933  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2810  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1386  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
657 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
640 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
797 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
1162 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1401  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
798 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
826 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2023  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
585 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1388  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
421 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2509  hypothetical protein  24.49 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
677 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2550  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.930398  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0939  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.709084 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1812  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
875 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.515485  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1477  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
877 aa  57.4  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
1523 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
397 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  35.42 
 
 
362 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2559  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 
754 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.52 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1385  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
377 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
255 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0323  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00034223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
1523 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1511  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.675878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  33.33 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  36.17 
 
 
1435 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
396 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0171  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
860 aa  53.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0169  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
860 aa  53.5  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  35.87 
 
 
400 aa  53.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0220  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
608 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
1268 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1372  glycosyl transferase family protein  22.52 
 
 
633 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  28.69 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  32.04 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  32.04 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  34.78 
 
 
427 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0515  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
857 aa  51.2  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1578  glycosyl transferase  22.89 
 
 
183 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0848772  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  29.81 
 
 
259 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
255 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.25 
 
 
2145 aa  50.4  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  35.23 
 
 
392 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0270  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
397 aa  49.7  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  35.23 
 
 
392 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  28.85 
 
 
259 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
521 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
535 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1402  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
646 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2521  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
444 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00644687  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1337  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
438 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00375711  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
251 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3656  glycosyl transferase family 2  34.83 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306407 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4733  glycosyl transferase family 2  34.83 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>