More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0478 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  100 
 
 		 2851 aa  5719    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  48.26 
 
 		 3554 aa  772    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  62.06 
 
 		 2914 aa  575  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  47.86 
 
 		 5143 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  44.88 
 
 		 4238 aa  350  2e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  43.23 
 
 		 3737 aa  285  7.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  46.2 
 
 		 4526 aa  277  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  37.55 
 
 		 3078 aa  243  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  29.8 
 
 		 1813 aa  236  5e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  39.31 
 
 		 2906 aa  218  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  28.13 
 
 		 2073 aa  214  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  27.77 
 
 		 2075 aa  206  4e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  28.7 
 
 		 2078 aa  170  5e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  31.61 
 
 		 3920 aa  169  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  32.66 
 
 		 2078 aa  158  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  30.35 
 
 		 2092 aa  152  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  32.51 
 
 		 2091 aa  148  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  52.26 
 
 		 403 aa  144  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.3 
 
 		 689 aa  142  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  45.61 
 
 		 400 aa  139  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  58.02 
 
 		 344 aa  137  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  29.89 
 
 		 842 aa  134  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  40 
 
 		 209 aa  126  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  32.06 
 
 		 585 aa  125  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  38.49 
 
 		 442 aa  124  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  32.61 
 
 		 1014 aa  121  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  32.82 
 
 		 748 aa  118  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  43.42 
 
 		 382 aa  118  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  30.33 
 
 		 643 aa  117  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  27.1 
 
 		 936 aa  113  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  48.68 
 
 		 493 aa  113  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  47.06 
 
 		 582 aa  112  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1408 aa  112  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  39.57 
 
 		 1101 aa  108  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  30.53 
 
 		 712 aa  107  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  57.27 
 
 		 439 aa  107  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  57.27 
 
 		 437 aa  107  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  41.04 
 
 		 492 aa  106  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  31.14 
 
 		 835 aa  104  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  38.22 
 
 		 468 aa  104  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  30.84 
 
 		 838 aa  104  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  31.37 
 
 		 813 aa  103  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  58.16 
 
 		 451 aa  102  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  37.89 
 
 		 466 aa  102  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  46 
 
 		 473 aa  102  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  41.29 
 
 		 606 aa  101  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  48.25 
 
 		 283 aa  101  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  58.16 
 
 		 437 aa  101  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  58.16 
 
 		 437 aa  101  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  36.55 
 
 		 835 aa  99.8  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  48.04 
 
 		 322 aa  99.4  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  57.14 
 
 		 438 aa  99  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  33.63 
 
 		 998 aa  99.4  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  55.26 
 
 		 645 aa  98.2  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  41.94 
 
 		 523 aa  96.7  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  57.14 
 
 		 434 aa  96.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  31.95 
 
 		 835 aa  96.7  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  43.14 
 
 		 481 aa  94.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  43.14 
 
 		 478 aa  94.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  38.32 
 
 		 587 aa  94.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  26.99 
 
 		 1168 aa  92  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  44.91 
 
 		 767 aa  92  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  27.23 
 
 		 706 aa  91.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  26.5 
 
 		 1219 aa  91.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  43.65 
 
 		 319 aa  90.5  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  42.7 
 
 		 542 aa  89.7  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  43.12 
 
 		 582 aa  89.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  29.47 
 
 		 462 aa  89  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  43.64 
 
 		 274 aa  88.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  35.59 
 
 		 474 aa  88.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  30.41 
 
 		 810 aa  88.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  45.83 
 
 		 436 aa  87.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  54.31 
 
 		 212 aa  87.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  26.13 
 
 		 815 aa  86.7  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  52.17 
 
 		 288 aa  85.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  31.76 
 
 		 512 aa  85.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  27.55 
 
 		 536 aa  85.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1147 aa  84.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  26.67 
 
 		 934 aa  84.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  27.24 
 
 		 1170 aa  85.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  42.86 
 
 		 1426 aa  85.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  52.38 
 
 		 303 aa  84.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  42.16 
 
 		 300 aa  85.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  48.11 
 
 		 297 aa  84.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  30.15 
 
 		 459 aa  84.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  31.91 
 
 		 4726 aa  84.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  57.53 
 
 		 308 aa  84.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  39.43 
 
 		 366 aa  83.2  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  48.18 
 
 		 222 aa  82.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  37.08 
 
 		 867 aa  82  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  27.12 
 
 		 1580 aa  81.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  39.46 
 
 		 380 aa  82  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  34.62 
 
 		 1472 aa  81.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  34.62 
 
 		 1447 aa  81.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  34.62 
 
 		 1342 aa  81.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  34.62 
 
 		 1447 aa  81.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  34.62 
 
 		 1446 aa  80.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  30.54 
 
 		 2095 aa  80.9  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  31.52 
 
 		 575 aa  80.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  47.45 
 
 		 307 aa  80.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>