More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3615 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  81 
 
 		 458 aa  775    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 465 aa  974    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  86.1 
 
 		 460 aa  818    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  75.65 
 
 		 460 aa  752    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  41 
 
 		 462 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  40.71 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  40.97 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  39.36 
 
 		 466 aa  363  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  38.95 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  40.57 
 
 		 479 aa  359  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  40.55 
 
 		 452 aa  349  6e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  38.53 
 
 		 465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  41.34 
 
 		 462 aa  329  8e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  37.1 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  39 
 
 		 471 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  39.07 
 
 		 446 aa  316  6e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  36.51 
 
 		 482 aa  309  5e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 482 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  36.81 
 
 		 477 aa  302  7.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  35.85 
 
 		 482 aa  300  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 481 aa  295  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 		 486 aa  294  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  37.8 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  37.8 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  36.48 
 
 		 357 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  31.97 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  33.66 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  34.97 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 		 362 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.9 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 377 aa  96.3  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.39 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 380 aa  93.6  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 		 325 aa  93.6  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 380 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.07 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 389 aa  91.7  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 317 aa  90.9  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 404 aa  89.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  29.69 
 
 		 510 aa  87  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.82 
 
 		 349 aa  86.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  25 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  32.6 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.3 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  25.71 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  27.24 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  35.11 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 323 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.19 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.94 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.94 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  25.62 
 
 		 561 aa  79  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.07 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.78 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  29.66 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  32.6 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.46 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  22.55 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  25.53 
 
 		 769 aa  75.5  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  23.28 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.42 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.62 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>