More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4166 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4166  UspA domain protein  100 
 
 		 152 aa  289  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.441072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2864  UspA domain protein  58.94 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  52.98 
 
 		 146 aa  143  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  52.98 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  52.32 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  52.98 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  52.98 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  52.98 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2426  UspA domain protein  52.63 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.384614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28580  universal stress protein UspA-like protein  55.63 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  51.66 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  49.01 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  38.16 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  32.47 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  32.43 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.08 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.33 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.61 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.48 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.68 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3952  UspA domain protein  35.26 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.87 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  29.14 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  29.8 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.19 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0390  UspA domain-containing protein  41.04 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  27.15 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.11 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  36.6 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  32.89 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.95 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  33.12 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.06 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.86 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  28.57 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.77 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.15 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  27.92 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  27.92 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  27.92 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  27.92 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  27.92 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  29.49 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 289 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  27.92 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  27.92 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  31.72 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3813  UspA domain protein  32.88 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  29.93 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  35.76 
 
 		 310 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  27.92 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  28.12 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  34.83 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  26.58 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  32.64 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.39 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  33.79 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  28.57 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  27.21 
 
 		 341 aa  51.6  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  28.95 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  29.93 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  24.49 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  30.38 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.85 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  28.85 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  30.38 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  30.38 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  31.76 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  26.45 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  26.62 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  24.24 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.55 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  34.23 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.13 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  24.66 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.14 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 291 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.06 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>