231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3813 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3813  UspA domain protein  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  76.92 
 
 
143 aa  213  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3285  UspA domain protein  67.14 
 
 
140 aa  192  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  41.5 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  37.06 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  36.11 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2864  UspA domain protein  34.03 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  34.87 
 
 
274 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  29.53 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28.47 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0192  UspA domain protein  34.06 
 
 
288 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  28.1 
 
 
173 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  26.8 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  31.94 
 
 
300 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  33.58 
 
 
294 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  26.12 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  37.23 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.08 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.01 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
293 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.91 
 
 
288 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
289 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.37 
 
 
320 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
142 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  25.55 
 
 
150 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  29.45 
 
 
295 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.79 
 
 
145 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 
138 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30.71 
 
 
162 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  30.43 
 
 
156 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  32.89 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  26.87 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  27.78 
 
 
148 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  32.64 
 
 
174 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  30.15 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  29.1 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  33.33 
 
 
306 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.27 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  31.25 
 
 
285 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  27.41 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  31.97 
 
 
288 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  33.33 
 
 
280 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 
274 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
288 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
294 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  26.42 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.27 
 
 
303 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
319 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  26.42 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  30.87 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
188 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  25.81 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  27.41 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  29.37 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  33.56 
 
 
273 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
300 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  28.26 
 
 
142 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
147 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
291 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4578  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
218 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.911716  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  28.47 
 
 
309 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
151 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.85 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  33.57 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
167 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 
147 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 
287 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  30 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4166  UspA domain protein  31.51 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.441072  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  31.65 
 
 
287 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.01 
 
 
321 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13155  hypothetical protein  31.16 
 
 
268 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.955423 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  28.79 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  29.08 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  29.8 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  23.81 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  29.53 
 
 
345 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  26.81 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D31  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.82 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.575009  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  30.5 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  31.76 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  25 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.47 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
296 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>