More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3215 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 265 aa  504  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  63.64 
 
 		 269 aa  324  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  64.5 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  63.74 
 
 		 262 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  61.22 
 
 		 263 aa  305  6e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  61.83 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  61.83 
 
 		 262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  61.83 
 
 		 262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  62.64 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  64.77 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  59.77 
 
 		 261 aa  295  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  65.83 
 
 		 277 aa  295  6e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  67.36 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  60.46 
 
 		 273 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  64.34 
 
 		 270 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  62.64 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  66.02 
 
 		 276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  68.06 
 
 		 306 aa  284  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  61.6 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  65.43 
 
 		 273 aa  281  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  58.14 
 
 		 275 aa  281  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  62.99 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  58.3 
 
 		 261 aa  279  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  59.09 
 
 		 264 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  63.78 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  58.23 
 
 		 274 aa  272  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  61.6 
 
 		 272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  62.41 
 
 		 270 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  64.57 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  64.84 
 
 		 269 aa  258  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  51.15 
 
 		 289 aa  256  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  63.64 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  54.33 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  58.19 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  55.06 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  54.72 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  58.3 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  50.21 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  46.27 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  40.25 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 267 aa  181  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  42.8 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  37.45 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  35.57 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  39.37 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  40.6 
 
 		 269 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  38.35 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  37.79 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  37.92 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  37.92 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  36.98 
 
 		 267 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  42.21 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  40.61 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  41.98 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  40.98 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  40.98 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  41.35 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  44.14 
 
 		 285 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  39.47 
 
 		 269 aa  168  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  40.57 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  39.46 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.35 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.26 
 
 		 302 aa  166  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  39.47 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  36.89 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  39.68 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  38.82 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 		 268 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  40.83 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  44.24 
 
 		 275 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  42.59 
 
 		 285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  39.92 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  29.5 
 
 		 258 aa  165  9e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>