More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2049 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 595 aa  1150    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  38.92 
 
 		 562 aa  349  9e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  38.36 
 
 		 584 aa  336  7e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  39.71 
 
 		 549 aa  330  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  35.73 
 
 		 587 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  34.42 
 
 		 593 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  34.66 
 
 		 603 aa  293  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 		 587 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  35.08 
 
 		 568 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  32.07 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  36.61 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  34.82 
 
 		 564 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  29.6 
 
 		 610 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  34.62 
 
 		 562 aa  240  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 573 aa  229  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  31.19 
 
 		 573 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  30.05 
 
 		 594 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.72 
 
 		 560 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 569 aa  216  8e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  32.56 
 
 		 586 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.63 
 
 		 614 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 599 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 582 aa  173  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 		 595 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  27.32 
 
 		 566 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  29.42 
 
 		 539 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 538 aa  130  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 580 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  24.87 
 
 		 568 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 540 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2038  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 540 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26.3 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 561 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 517 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.46 
 
 		 565 aa  107  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.19 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 528 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 545 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 510 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 531 aa  100  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 523 aa  98.2  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3425  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 		 563 aa  98.6  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  25.21 
 
 		 523 aa  98.2  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 		 544 aa  98.2  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 588 aa  97.4  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 525 aa  97.1  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 536 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 595 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  25 
 
 		 549 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 528 aa  95.9  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2848  4-phytase  27.79 
 
 		 563 aa  96.3  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 511 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 531 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 553 aa  93.6  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.83 
 
 		 516 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 531 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.79 
 
 		 535 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2067  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.61 
 
 		 553 aa  92  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.2 
 
 		 541 aa  92  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 532 aa  92  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2540  peptide transport periplasmic protein precursor  24.95 
 
 		 548 aa  91.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.53 
 
 		 544 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 538 aa  90.5  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  25.46 
 
 		 526 aa  90.5  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 534 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 532 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 532 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1828  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.83 
 
 		 539 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.011145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.72 
 
 		 531 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  21.54 
 
 		 521 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.54 
 
 		 521 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 531 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1501  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.83 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.77 
 
 		 531 aa  89.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  21.54 
 
 		 521 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2331  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 		 590 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.55 
 
 		 545 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1530  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.83 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.414717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 521 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 531 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 521 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 532 aa  88.6  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 516 aa  88.6  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  21.36 
 
 		 521 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1892  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 547 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110335  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 505 aa  89  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1784  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.53 
 
 		 547 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1816  peptide transport periplasmic protein SapA  24.83 
 
 		 549 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.440252  hitchhiker  0.00000000112139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1640  peptide transport periplasmic protein SapA  24.83 
 
 		 549 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 534 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>