More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2540 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01271  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  76.15 
 
 
547 aa  843    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2352  extracellular solute-binding protein family 5  76.15 
 
 
547 aa  843    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2540  peptide transport periplasmic protein precursor  100 
 
 
548 aa  1129    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1816  peptide transport periplasmic protein SapA  75.6 
 
 
549 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.440252  hitchhiker  0.00000000112139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  75.69 
 
 
549 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  75.77 
 
 
582 aa  879    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1408  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  76.15 
 
 
547 aa  843    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01282  hypothetical protein  76.15 
 
 
547 aa  843    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1878  peptide transport periplasmic protein SapA  75.69 
 
 
557 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00804887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1892  extracellular solute-binding protein  99.64 
 
 
547 aa  1064    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  76.87 
 
 
562 aa  895    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1784  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  99.64 
 
 
547 aa  1064    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1640  peptide transport periplasmic protein SapA  75.6 
 
 
549 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000341731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  83.21 
 
 
550 aa  938    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1458  peptide transport periplasmic protein SapA  75.6 
 
 
549 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  76.14 
 
 
580 aa  887    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1828  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  76.48 
 
 
539 aa  841    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.011145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2171  extracellular solute-binding protein  75.09 
 
 
546 aa  825    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2331  extracellular solute-binding protein  76.15 
 
 
547 aa  843    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.815677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  75.93 
 
 
539 aa  834    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.101699 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1530  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  76.15 
 
 
547 aa  843    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.414717  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1718  extracellular solute-binding protein family 5  75.96 
 
 
581 aa  878    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1501  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  76.15 
 
 
547 aa  843    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0479  peptide transport periplasmic protein precursor SapA  45.49 
 
 
541 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  42.67 
 
 
541 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  44.03 
 
 
525 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003816  peptide transport periplasmic protein SapA  44.46 
 
 
539 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  42.91 
 
 
541 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  44.03 
 
 
525 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01870  hypothetical protein  45.02 
 
 
539 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  42.1 
 
 
541 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  43.1 
 
 
541 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  42.49 
 
 
541 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  42.46 
 
 
547 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1285  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  45.42 
 
 
540 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  42.83 
 
 
541 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  42.83 
 
 
525 aa  458  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  42.23 
 
 
551 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  42.83 
 
 
542 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  43.73 
 
 
542 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  42.26 
 
 
582 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  41.22 
 
 
544 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  42.77 
 
 
556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02835  putative ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  41.11 
 
 
578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  40.99 
 
 
549 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  38.52 
 
 
535 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 
531 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  38.33 
 
 
535 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  38.33 
 
 
535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  38.33 
 
 
535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  38.33 
 
 
535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  38.33 
 
 
535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  38.33 
 
 
535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  38.33 
 
 
535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  38.08 
 
 
506 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  37.27 
 
 
535 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  37.41 
 
 
526 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  39.02 
 
 
531 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 
535 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  37.41 
 
 
526 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  37.41 
 
 
526 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  38.12 
 
 
535 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  37.41 
 
 
526 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  37.22 
 
 
526 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 
535 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  37.74 
 
 
535 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  37.45 
 
 
535 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  38.05 
 
 
531 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  36.42 
 
 
535 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  36.42 
 
 
535 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0594  peptide ABC transporter, periplasmic-binding protein  38.1 
 
 
562 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.564656  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  36.42 
 
 
535 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  37.94 
 
 
531 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  37.6 
 
 
531 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 
538 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  37.27 
 
 
531 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 
542 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 
535 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  38.69 
 
 
533 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  36.09 
 
 
532 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 
532 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.9 
 
 
535 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  36.35 
 
 
537 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  36.56 
 
 
531 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  36.47 
 
 
531 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 
532 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  36.51 
 
 
533 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 
529 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 
532 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  35.56 
 
 
537 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  36.31 
 
 
533 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 
531 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  36.71 
 
 
530 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  37.63 
 
 
532 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 
530 aa  361  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2192  peptide ABC transporter extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 
539 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169024  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  36.49 
 
 
532 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  37.6 
 
 
532 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 
531 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>