More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1306 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
406 aa  803    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  45.3 
 
 
412 aa  318  9e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  47.58 
 
 
425 aa  311  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  41.24 
 
 
389 aa  293  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  44.36 
 
 
415 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  42.75 
 
 
428 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  44.24 
 
 
431 aa  279  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  41.95 
 
 
412 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  42.82 
 
 
405 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3042  protein serine/threonine phosphatase  44.68 
 
 
492 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0802508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  41.28 
 
 
423 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2934  protein serine/threonine phosphatase  38.66 
 
 
406 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  32.67 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4114  protein serine/threonine phosphatase  31.14 
 
 
426 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  35.37 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  34.48 
 
 
414 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  32.23 
 
 
705 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  31.01 
 
 
451 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  33.82 
 
 
453 aa  106  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  31.47 
 
 
684 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  30.89 
 
 
754 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  29.92 
 
 
648 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  31.45 
 
 
533 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  31.27 
 
 
642 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.71 
 
 
423 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  31.05 
 
 
1100 aa  99.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  30.58 
 
 
465 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.1 
 
 
388 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  29.47 
 
 
455 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  34.24 
 
 
350 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.22 
 
 
465 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  33.81 
 
 
470 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.63 
 
 
486 aa  97.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  31.3 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  30.4 
 
 
644 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.12 
 
 
606 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  33.21 
 
 
853 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  29.6 
 
 
683 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  29.8 
 
 
445 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  29.41 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.31 
 
 
467 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  32.22 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  35.96 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  28.79 
 
 
716 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  31.79 
 
 
469 aa  93.6  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  35.41 
 
 
369 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.86 
 
 
407 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  29.79 
 
 
642 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  34.3 
 
 
395 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  30.72 
 
 
708 aa  91.3  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  35.48 
 
 
372 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  26.1 
 
 
459 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  28.1 
 
 
410 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  28.35 
 
 
630 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  28.98 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.71 
 
 
486 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  31.07 
 
 
631 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  27.3 
 
 
705 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  39.61 
 
 
375 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  32.7 
 
 
376 aa  89.4  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  28.74 
 
 
454 aa  89.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  32.67 
 
 
400 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  28.51 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  31.75 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  33.65 
 
 
262 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  29.3 
 
 
447 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  29.57 
 
 
649 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.3 
 
 
961 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  28.86 
 
 
464 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.95 
 
 
447 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.39 
 
 
748 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  28.17 
 
 
1079 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  33.17 
 
 
455 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  30.04 
 
 
396 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  29.89 
 
 
1083 aa  86.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  34.62 
 
 
361 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.92 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.77 
 
 
678 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  32.21 
 
 
315 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  26.1 
 
 
634 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.92 
 
 
1087 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  29.32 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  27.41 
 
 
612 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.79 
 
 
563 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 
519 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  31.67 
 
 
502 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.19 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.48 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  29.84 
 
 
708 aa  84  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  28.15 
 
 
545 aa  83.6  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  25.99 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  30.71 
 
 
846 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.19 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
660 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  31.31 
 
 
633 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  34.58 
 
 
550 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  33.65 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  29.39 
 
 
1082 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.45 
 
 
549 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  31.2 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>