More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1669 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 676 aa  1386    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  45.85 
 
 		 662 aa  558  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  40.56 
 
 		 715 aa  499  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  39.64 
 
 		 678 aa  478  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  38.86 
 
 		 680 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  38.74 
 
 		 645 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  35.56 
 
 		 642 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  34.12 
 
 		 615 aa  362  9e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 710 aa  339  9e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  28.39 
 
 		 687 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.78 
 
 		 667 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  27.12 
 
 		 718 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 643 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  28.24 
 
 		 670 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 679 aa  128  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 714 aa  125  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 687 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 799 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 671 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 699 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 799 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 684 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 799 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 707 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  31.85 
 
 		 705 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  41.22 
 
 		 702 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 705 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  22.69 
 
 		 704 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  22.69 
 
 		 704 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  25.59 
 
 		 652 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  26.35 
 
 		 641 aa  104  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  36 
 
 		 653 aa  104  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 613 aa  104  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 715 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25 
 
 		 656 aa  100  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 681 aa  99.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.27 
 
 		 666 aa  99.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.14 
 
 		 666 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.14 
 
 		 666 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.14 
 
 		 666 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  24.46 
 
 		 732 aa  98.2  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 702 aa  98.2  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  23.11 
 
 		 656 aa  97.8  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.14 
 
 		 666 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  23.36 
 
 		 698 aa  96.7  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.93 
 
 		 663 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 663 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 715 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  32.93 
 
 		 641 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.93 
 
 		 663 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.93 
 
 		 659 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 		 668 aa  96.3  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.93 
 
 		 663 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 681 aa  96.3  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.93 
 
 		 663 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.93 
 
 		 663 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  23.6 
 
 		 663 aa  95.5  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  36.31 
 
 		 673 aa  95.5  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  31.8 
 
 		 668 aa  95.1  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 640 aa  94.7  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 645 aa  94.7  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 634 aa  94.7  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 713 aa  93.6  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 710 aa  93.6  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  25.5 
 
 		 668 aa  92.8  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  23.42 
 
 		 671 aa  92.4  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 682 aa  92  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.28 
 
 		 650 aa  91.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  32.2 
 
 		 618 aa  91.3  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 648 aa  91.3  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.05 
 
 		 663 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  33.12 
 
 		 650 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  33.12 
 
 		 650 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 893 aa  90.5  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  33.12 
 
 		 650 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 649 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.12 
 
 		 650 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  22.42 
 
 		 661 aa  89.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  21.9 
 
 		 665 aa  89.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25 
 
 		 653 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  22.55 
 
 		 696 aa  89.4  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  35.27 
 
 		 1023 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 670 aa  89  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.58 
 
 		 686 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 801 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 665 aa  89  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 634 aa  88.6  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 657 aa  87.8  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 635 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  35.5 
 
 		 662 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  32.32 
 
 		 617 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  40.27 
 
 		 616 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  24.41 
 
 		 700 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 826 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 678 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.48 
 
 		 646 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  36.92 
 
 		 716 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  25.47 
 
 		 703 aa  83.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.41 
 
 		 630 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>