104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0850 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  55.15 
 
 		 377 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  52.75 
 
 		 439 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  49.73 
 
 		 443 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  49.73 
 
 		 443 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  49.73 
 
 		 443 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  50.91 
 
 		 411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  49.15 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.7 
 
 		 434 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  38.2 
 
 		 389 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  48.52 
 
 		 216 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.51 
 
 		 506 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.67 
 
 		 417 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  46.05 
 
 		 423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  47.9 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.06 
 
 		 662 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  47.62 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.56 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.15 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  47.31 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  47.31 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  47.31 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.39 
 
 		 815 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  50.34 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  43.45 
 
 		 466 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  42.86 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  51.72 
 
 		 546 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.86 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  42.2 
 
 		 249 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.79 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.11 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.24 
 
 		 421 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  40.72 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  40.8 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 411 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.38 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  44.22 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  39.52 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  39.52 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  41.79 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  43.11 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  38.92 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  38.69 
 
 		 212 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  35.26 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  32.75 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  33.11 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  44.59 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  31.36 
 
 		 844 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  33.33 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 906 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  31.93 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  32.28 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  38.95 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  31.97 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  39.29 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  31.94 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.48 
 
 		 354 aa  52  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  28.83 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  38.16 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  32.81 
 
 		 438 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  25.97 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  36.36 
 
 		 423 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  25.54 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  33.79 
 
 		 392 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.71 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  29.25 
 
 		 440 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  31.25 
 
 		 438 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  32.38 
 
 		 352 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  31.25 
 
 		 438 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  30 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  31.25 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  24.75 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  45.65 
 
 		 682 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  25.17 
 
 		 433 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  28.39 
 
 		 418 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 384 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  39.36 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.84 
 
 		 336 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.84 
 
 		 336 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  30.34 
 
 		 445 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  30.26 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  47.62 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  38.14 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  37.23 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  27.14 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  27.92 
 
 		 720 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  25.4 
 
 		 419 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 448 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  29.66 
 
 		 448 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  26.21 
 
 		 445 aa  43.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  27.98 
 
 		 427 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  27.35 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  34.78 
 
 		 559 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  25.32 
 
 		 474 aa  42.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  24.65 
 
 		 341 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>