164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1186 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 776 aa  1592    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  67.61 
 
 		 777 aa  1091    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  43.11 
 
 		 784 aa  598  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  38.53 
 
 		 804 aa  482  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  34.74 
 
 		 800 aa  438  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  34.12 
 
 		 772 aa  397  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  34.63 
 
 		 821 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  30.38 
 
 		 800 aa  340  5.9999999999999996e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  31.94 
 
 		 778 aa  325  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  29.48 
 
 		 765 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  30.98 
 
 		 783 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  31.41 
 
 		 822 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  31.8 
 
 		 858 aa  300  8e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.13 
 
 		 821 aa  297  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  31.38 
 
 		 807 aa  296  8e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  31.81 
 
 		 836 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  29.7 
 
 		 721 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.43 
 
 		 820 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  30.36 
 
 		 730 aa  236  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  30.38 
 
 		 856 aa  224  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  29.81 
 
 		 781 aa  220  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  29.02 
 
 		 864 aa  219  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.59 
 
 		 733 aa  215  2.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.53 
 
 		 724 aa  209  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  29.52 
 
 		 801 aa  197  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  29.58 
 
 		 825 aa  196  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.17 
 
 		 744 aa  194  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 722 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  27.99 
 
 		 732 aa  187  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.17 
 
 		 724 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  27.16 
 
 		 740 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  28.4 
 
 		 753 aa  182  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 		 829 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  28.15 
 
 		 834 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  28.88 
 
 		 904 aa  180  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  28.59 
 
 		 731 aa  180  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  28.07 
 
 		 759 aa  180  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  29.26 
 
 		 739 aa  179  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.81 
 
 		 794 aa  178  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  34.44 
 
 		 717 aa  177  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  29.43 
 
 		 782 aa  177  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 		 745 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 		 732 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  26.63 
 
 		 939 aa  172  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  31.37 
 
 		 667 aa  168  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.27 
 
 		 692 aa  167  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.77 
 
 		 751 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 728 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 		 772 aa  163  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.19 
 
 		 752 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  28.01 
 
 		 745 aa  162  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  29.11 
 
 		 661 aa  158  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 		 1078 aa  158  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 		 792 aa  157  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  32.79 
 
 		 722 aa  157  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.83 
 
 		 824 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  32.47 
 
 		 1084 aa  147  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  24.4 
 
 		 805 aa  147  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  29.54 
 
 		 651 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.57 
 
 		 792 aa  127  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  28.29 
 
 		 747 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  24.07 
 
 		 729 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  25.56 
 
 		 794 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.57 
 
 		 738 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 880 aa  100  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  25.2 
 
 		 794 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  26.32 
 
 		 750 aa  94  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 		 729 aa  89.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  23.28 
 
 		 781 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  24.04 
 
 		 737 aa  88.6  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  25.35 
 
 		 801 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  26.62 
 
 		 804 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  25.97 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  25.14 
 
 		 780 aa  79  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  24.03 
 
 		 779 aa  79  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  23.56 
 
 		 927 aa  77.8  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  25.27 
 
 		 726 aa  77  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  24.94 
 
 		 907 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  23.17 
 
 		 783 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  24 
 
 		 741 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  24.19 
 
 		 744 aa  75.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  24.26 
 
 		 828 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  27.24 
 
 		 899 aa  73.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  24.93 
 
 		 775 aa  72.8  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  24.56 
 
 		 795 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  22.6 
 
 		 741 aa  72.4  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  35.43 
 
 		 799 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  22.31 
 
 		 750 aa  72  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  25.42 
 
 		 905 aa  71.6  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  24.4 
 
 		 736 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  23.6 
 
 		 1027 aa  70.5  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.45 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25 
 
 		 885 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  23.67 
 
 		 854 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  22.03 
 
 		 763 aa  67.8  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  24.38 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  34.55 
 
 		 948 aa  65.5  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  22.57 
 
 		 827 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  28.93 
 
 		 843 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  26.51 
 
 		 922 aa  62.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>