279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6740 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6740  SMF family protein  100 
 
 		 283 aa  522  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00228077  normal  0.067475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6742  SMF family protein  41.81 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0382369  normal  0.0640366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6741  putative DNA processing smf-family protein  40.57 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000806567  normal  0.0643644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  37.39 
 
 		 408 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  37.75 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  37.34 
 
 		 400 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  34.87 
 
 		 446 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 		 475 aa  89  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  36.63 
 
 		 378 aa  88.6  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  34.52 
 
 		 394 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  36.13 
 
 		 402 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.86 
 
 		 396 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  32.01 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  34.87 
 
 		 600 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  33.47 
 
 		 402 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  36.65 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  32.2 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  35.48 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  36.23 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  32.64 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  33.99 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  34.72 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  35.9 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  28.35 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  33.19 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  34.74 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  32.81 
 
 		 423 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  31.2 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  30.34 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  30.34 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  30.34 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  30.34 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  36.92 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  36.62 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  36.62 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  34.76 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  30.51 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  36.15 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  34.54 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  36.15 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  37.66 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  30.93 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  36.15 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  36.15 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  32.86 
 
 		 402 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  35.98 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  26.43 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  36.41 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  33.47 
 
 		 553 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  30.93 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  30.93 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  35.75 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  33.88 
 
 		 399 aa  72.4  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  38.53 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  31.82 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  28.57 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  35.32 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  32.68 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  35.03 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  33.07 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  35.32 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  32.99 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  33.18 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  32.81 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  34.69 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  33.5 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  33.66 
 
 		 378 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  33.33 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  33.85 
 
 		 403 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  35.05 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  33.5 
 
 		 592 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  31.6 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  34.68 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  31.15 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  29.6 
 
 		 368 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  37.89 
 
 		 422 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  29.49 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  37.89 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  33.7 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  33.7 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  32.47 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  31.73 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  30.86 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  29.29 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  32.24 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  32.34 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  27.96 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4789  SMF family protein  35.43 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  27.43 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  27.75 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  37.27 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  26.47 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  32 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>