108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6335 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6335  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  46.51 
 
 		 457 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  39.85 
 
 		 963 aa  92  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  41.54 
 
 		 801 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  37.76 
 
 		 1056 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  41.35 
 
 		 751 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.11 
 
 		 1186 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  40.26 
 
 		 493 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 568 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.95 
 
 		 568 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 787 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1039 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  41.51 
 
 		 924 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  37.11 
 
 		 1488 aa  61.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 454 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.86 
 
 		 1424 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  37.72 
 
 		 672 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.94 
 
 		 767 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  38.1 
 
 		 1288 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  36.78 
 
 		 577 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 		 1215 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 843 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 1262 aa  58.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  32.69 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  34.78 
 
 		 1106 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  35.54 
 
 		 1131 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 814 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  31.15 
 
 		 680 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  32.97 
 
 		 1040 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  38.27 
 
 		 1328 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 771 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 1105 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.79 
 
 		 885 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  32.32 
 
 		 825 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  40.66 
 
 		 849 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 640 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 911 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 669 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  34.58 
 
 		 1050 aa  54.7  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  37.35 
 
 		 919 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2833  TPR repeat-containing protein  43.1 
 
 		 344 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  37.11 
 
 		 1128 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  27.14 
 
 		 977 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 949 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  35 
 
 		 1136 aa  53.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 444 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08563  conserved hypothetical protein  32.69 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1902  hypothetical protein  45.61 
 
 		 310 aa  52  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 953 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  47.37 
 
 		 1468 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  36.73 
 
 		 1228 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  46.67 
 
 		 304 aa  51.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 667 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 		 991 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  29.17 
 
 		 362 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  36.26 
 
 		 1146 aa  50.4  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  34.12 
 
 		 919 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 851 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4122  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.51 
 
 		 1126 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289873  decreased coverage  0.00939921 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1550 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  34.52 
 
 		 686 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11710  hypothetical protein  32.77 
 
 		 298 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.898295  normal  0.617645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  32.77 
 
 		 702 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1068 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 837 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  31.96 
 
 		 725 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  42.67 
 
 		 966 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  50.72 
 
 		 829 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 785 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  31.96 
 
 		 1185 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  37.33 
 
 		 1290 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1212 aa  46.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  34.48 
 
 		 1000 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  35.29 
 
 		 934 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  46 
 
 		 899 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  30.19 
 
 		 1125 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05237  conserved hypothetical protein  34.15 
 
 		 551 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00419082  hitchhiker  0.0029586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.16 
 
 		 732 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 469 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  31.82 
 
 		 2145 aa  45.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  34.12 
 
 		 1475 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1404 aa  44.3  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.78 
 
 		 841 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.25 
 
 		 1036 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  30.68 
 
 		 828 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  40.62 
 
 		 847 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 443 aa  43.5  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1028 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  29.29 
 
 		 822 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  33.33 
 
 		 859 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  30.39 
 
 		 1507 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  32.81 
 
 		 675 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.05 
 
 		 602 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 1283 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  36.78 
 
 		 713 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 		 900 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>