108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4093 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  79.03 
 
 		 198 aa  298  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 		 283 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  48.26 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  34.69 
 
 		 548 aa  92.4  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3885  hypothetical protein  30.94 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  37.09 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1277  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.744115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  35.29 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  26.24 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  32.89 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  25.53 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  33.55 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  33.55 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  32.06 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  24.52 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  32.17 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 136 aa  48.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  27.39 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  49.06 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  49.06 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  35.92 
 
 		 248 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 158 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  62.86 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  64.52 
 
 		 260 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  47.17 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0516  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  28 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0152  ADP-ribose pyrophosphatase with uncharacterized conserved domain  42.31 
 
 		 312 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  34.59 
 
 		 158 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 302 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 165 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  23.4 
 
 		 164 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  34.59 
 
 		 158 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  34.59 
 
 		 158 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 163 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 156 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  46.94 
 
 		 128 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  47.17 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  47.17 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  47.17 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  47.17 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 282 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 153 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 156 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  41.07 
 
 		 342 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 132 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 137 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>