More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4752 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  312  9e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  62.5 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  46.36 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3525  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  40.74 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  34.94 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  38.89 
 
 		 177 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  36.59 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  29.1 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  35.29 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 193 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  24.09 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  31.91 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  21.97 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  40.62 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  31.48 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 180 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  31.91 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  30.95 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  31.46 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>