More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0561 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 		 1069 aa  734    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  49.32 
 
 		 1024 aa  1051    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.43 
 
 		 1052 aa  765    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  80.62 
 
 		 1038 aa  1727    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  37.6 
 
 		 1042 aa  759    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  37.22 
 
 		 1039 aa  746    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  37.79 
 
 		 1041 aa  767    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.93 
 
 		 1025 aa  686    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1032 aa  2069    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  37.78 
 
 		 1048 aa  761    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  35.51 
 
 		 1068 aa  720    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  36.81 
 
 		 1044 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  36.67 
 
 		 1045 aa  751    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1057 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  36.56 
 
 		 1034 aa  734    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  36.58 
 
 		 1038 aa  717    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  35.67 
 
 		 1033 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1067 aa  579  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 		 1189 aa  548  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1043 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1092 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1267 aa  422  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1143 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1191 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  29.57 
 
 		 1134 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  28.04 
 
 		 1335 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 		 1124 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  27.46 
 
 		 1165 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1034 aa  330  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1030 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1031 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1031 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1014 aa  326  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1031 aa  326  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1011 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.42 
 
 		 1050 aa  322  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.27 
 
 		 1031 aa  321  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  25.42 
 
 		 1042 aa  320  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1031 aa  319  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.25 
 
 		 1031 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.17 
 
 		 1034 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.25 
 
 		 1031 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.15 
 
 		 1024 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.25 
 
 		 1031 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1031 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1031 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  23.57 
 
 		 1020 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 		 1040 aa  312  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1046 aa  310  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1034 aa  308  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1033 aa  303  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.02 
 
 		 1044 aa  302  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1034 aa  301  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1038 aa  301  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1044 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  23.65 
 
 		 1062 aa  292  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  24.58 
 
 		 1031 aa  291  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  24.38 
 
 		 1043 aa  291  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.11 
 
 		 1024 aa  291  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 1496 aa  290  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1046 aa  289  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  23.46 
 
 		 1039 aa  289  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  21.62 
 
 		 1028 aa  288  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  23.2 
 
 		 1032 aa  288  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1290 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  23.42 
 
 		 1470 aa  287  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  24.6 
 
 		 1036 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  23.22 
 
 		 1041 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1038 aa  286  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1086 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.18 
 
 		 1049 aa  282  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1029 aa  282  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  23.05 
 
 		 1040 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1082 aa  280  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  23.99 
 
 		 1048 aa  280  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  21.53 
 
 		 1028 aa  279  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  23.44 
 
 		 1028 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  23.14 
 
 		 1026 aa  279  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  23.77 
 
 		 1024 aa  276  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  23.71 
 
 		 1045 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  23.25 
 
 		 1058 aa  273  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  24.25 
 
 		 1036 aa  272  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  23.41 
 
 		 1017 aa  272  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  24.07 
 
 		 1029 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  24.44 
 
 		 1083 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1087 aa  271  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.08 
 
 		 1036 aa  271  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  23.23 
 
 		 1035 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.17 
 
 		 1043 aa  271  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  21.66 
 
 		 1022 aa  270  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  22.74 
 
 		 1035 aa  269  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  23.71 
 
 		 1041 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  23.56 
 
 		 1034 aa  268  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  22.1 
 
 		 1020 aa  267  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1095 aa  267  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  23.13 
 
 		 1044 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  22.91 
 
 		 1050 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  23.46 
 
 		 1034 aa  265  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  23.38 
 
 		 1038 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  21.76 
 
 		 1071 aa  264  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>