115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4917 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4917  protein LpfE  100 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  51.19 
 
 		 175 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  51.19 
 
 		 175 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  51.19 
 
 		 175 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  49.71 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3982  protein LpfE  45.73 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  31.91 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  31.52 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  31.52 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  31.52 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  31.52 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  30.38 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  31.61 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  30.97 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  32.4 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  32.4 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  32.4 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  30.97 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  31.82 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  30.85 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  31.37 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  31.38 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  31.38 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  30.85 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  30.67 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  31.58 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  31.58 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  31.58 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  28.57 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  30.26 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  30.26 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  30.92 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  26.29 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  26.29 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  26.29 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.17 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  31.17 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  31.17 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  31.52 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  31.17 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  31.17 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  31.17 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  31.17 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  31.17 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  26.35 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  26.35 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30.26 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.57 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  27.57 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  27.57 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  27.57 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  27.57 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  27.57 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  27.57 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  27.17 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  28.04 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  28.57 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1105  fimbrial protein  27.63 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000686387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  32.08 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  27.91 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  27.91 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  27.91 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  27.91 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  27.91 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.87 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  28.14 
 
 		 362 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  25.83 
 
 		 336 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  26.29 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  25.16 
 
 		 355 aa  48.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2177  fimbrial protein  26.97 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  28.87 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.87 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  27.32 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  30.61 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  30.61 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  27.13 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  29.89 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  28.67 
 
 		 317 aa  45.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1019  fimbrial protein CupB6  24.66 
 
 		 379 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.89 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  29.89 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  29.89 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  29.89 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  25.42 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  25 
 
 		 305 aa  44.3  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  31.93 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  26.9 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  25 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  26.45 
 
 		 345 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  23.2 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  28.24 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  25 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  25 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  28.24 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30690  hypothetical protein  25.52 
 
 		 351 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000866279  hitchhiker  0.000842933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  23.24 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  30.64 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  25.32 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  28.24 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  30.64 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>