More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1628 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1628  response regulator receiver protein  100 
 
 		 380 aa  750    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  40.64 
 
 		 381 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0254  response regulator receiver modulated serine phosphatase  44.81 
 
 		 530 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00196419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.25 
 
 		 384 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.74 
 
 		 380 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  30.77 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.46 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.72 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  30.86 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.33 
 
 		 486 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.96 
 
 		 378 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  31.31 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.77 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  27.04 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.39 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.94 
 
 		 526 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.6 
 
 		 423 aa  109  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.35 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  26.73 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  24.79 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  25.45 
 
 		 459 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  31.53 
 
 		 1079 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.99 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  29.5 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.09 
 
 		 678 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  28.32 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.29 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.29 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.67 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  35.78 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.3 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0999  response regulator receiver protein  24.91 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.766542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  32.08 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 941 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  30.45 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  27.82 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  34.13 
 
 		 708 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.44 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.34 
 
 		 1087 aa  99.4  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  31.89 
 
 		 705 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3351  stage II sporulation E family protein  30.89 
 
 		 278 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  31.25 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.25 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  27.24 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.57 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.65 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  30.61 
 
 		 649 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  26.39 
 
 		 445 aa  96.7  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  30.96 
 
 		 706 aa  96.7  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  30.74 
 
 		 642 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  30.56 
 
 		 634 aa  96.3  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  33.63 
 
 		 660 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.83 
 
 		 423 aa  95.9  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  31.1 
 
 		 1087 aa  96.3  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.2 
 
 		 572 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.78 
 
 		 684 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  26.02 
 
 		 445 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.27 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  29.5 
 
 		 451 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.79 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  29.01 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 519 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.29 
 
 		 507 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  29.34 
 
 		 637 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  29.75 
 
 		 467 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  25.7 
 
 		 474 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  25.7 
 
 		 474 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  29.34 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  30 
 
 		 470 aa  93.6  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  30.98 
 
 		 687 aa  93.2  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  27.75 
 
 		 362 aa  93.2  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  26.71 
 
 		 474 aa  93.2  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  30.92 
 
 		 1083 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  25.98 
 
 		 465 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  30.18 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  29.2 
 
 		 846 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.98 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  27.94 
 
 		 463 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  28.46 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  30.15 
 
 		 1100 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  28.82 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.31 
 
 		 792 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  27.87 
 
 		 536 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  26.22 
 
 		 477 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2083  Stage II sporulation E family protein  32.63 
 
 		 556 aa  90.5  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.611306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  34.11 
 
 		 853 aa  90.5  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  26.27 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  29.75 
 
 		 612 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  29.71 
 
 		 723 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.92 
 
 		 1004 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  30.8 
 
 		 535 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  31.28 
 
 		 697 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  31.15 
 
 		 644 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  32.34 
 
 		 637 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.18 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  28.96 
 
 		 543 aa  87  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  24.4 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>