275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0569 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
504 aa  1021    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  42.83 
 
 
519 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  34.66 
 
 
527 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  35.91 
 
 
523 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  36.09 
 
 
522 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  34.9 
 
 
530 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  35.56 
 
 
528 aa  297  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  36.29 
 
 
525 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  32.49 
 
 
527 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  35.49 
 
 
539 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  36.26 
 
 
533 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  34.1 
 
 
587 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  37.14 
 
 
537 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  37.15 
 
 
538 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  35.12 
 
 
552 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  35.05 
 
 
587 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  32.61 
 
 
568 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  31.07 
 
 
551 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  35.12 
 
 
552 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  35.12 
 
 
552 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  35.12 
 
 
552 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  34.73 
 
 
587 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  35.12 
 
 
552 aa  249  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  34.07 
 
 
587 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  34.07 
 
 
587 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  34.51 
 
 
587 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  34.07 
 
 
587 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  34.88 
 
 
552 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  32.19 
 
 
569 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  34.83 
 
 
677 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  33.11 
 
 
600 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
603 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  32.68 
 
 
569 aa  243  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  34.16 
 
 
598 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  34.16 
 
 
598 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  34.16 
 
 
598 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  33.57 
 
 
563 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  37.01 
 
 
567 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  36.61 
 
 
539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 
593 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  33.93 
 
 
598 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  33.93 
 
 
598 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  33.93 
 
 
598 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  33.93 
 
 
598 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  36.54 
 
 
547 aa  237  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  32.22 
 
 
579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  32.76 
 
 
565 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  32 
 
 
579 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  32 
 
 
579 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  32 
 
 
576 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  32 
 
 
579 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  32.79 
 
 
560 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  36.84 
 
 
530 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  29.46 
 
 
590 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  30.83 
 
 
568 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  35.19 
 
 
580 aa  228  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  33.04 
 
 
552 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  31.81 
 
 
566 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  33.42 
 
 
536 aa  224  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  33.95 
 
 
561 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  30.53 
 
 
588 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  33.33 
 
 
562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  32.74 
 
 
541 aa  221  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  33.68 
 
 
548 aa  219  7.999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.09 
 
 
611 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.09 
 
 
611 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  38.1 
 
 
563 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  32.8 
 
 
567 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
540 aa  217  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  31.24 
 
 
565 aa  217  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  31.92 
 
 
519 aa  217  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  33.91 
 
 
551 aa  216  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  29.43 
 
 
566 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  35.31 
 
 
521 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  31.48 
 
 
584 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  32.73 
 
 
576 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2559  flagellar M-ring protein FliF  38.27 
 
 
533 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00858256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  30.3 
 
 
594 aa  210  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  30.91 
 
 
595 aa  210  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  38.21 
 
 
574 aa  209  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  32.47 
 
 
576 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  31.08 
 
 
571 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  34.96 
 
 
518 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1668  flagellar MS-ring protein  31.1 
 
 
567 aa  206  7e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  34.18 
 
 
525 aa  206  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  32.38 
 
 
538 aa  206  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  35.64 
 
 
524 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1394  flagellar M-ring protein FliF  37.5 
 
 
533 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0124624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  36.96 
 
 
498 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  32.66 
 
 
535 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  32.41 
 
 
552 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  34.03 
 
 
564 aa  204  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  34.03 
 
 
564 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  34.95 
 
 
552 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  31.55 
 
 
540 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  30.67 
 
 
566 aa  203  7e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  33.16 
 
 
539 aa  203  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 
570 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 
570 aa  202  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  31.28 
 
 
567 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>