More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2461 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2461  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 415 aa  869    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  26.14 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  32.05 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  22.13 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.07 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  33.61 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  37 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  33.98 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  40.21 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  43.21 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.57 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  33.96 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  35.64 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.9 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 359 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 332 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  31.01 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  34 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.25 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  25.54 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 459 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  34.02 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.68 
 
 		 333 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 501 aa  53.5  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  22.65 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 389 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.31 
 
 		 394 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  24.46 
 
 		 495 aa  53.1  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 450 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  24.54 
 
 		 384 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  24.39 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  36.22 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  33.61 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  22.65 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0301  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  34.82 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  32.52 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  22.58 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.62 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  23.53 
 
 		 349 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  33.66 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.49 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  31.43 
 
 		 359 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  34.74 
 
 		 363 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 489 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 327 aa  51.2  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 323 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  25.74 
 
 		 506 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  31.43 
 
 		 332 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 		 372 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  32.08 
 
 		 561 aa  50.4  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  24.86 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.63 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5711  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  37.89 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.91 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>