More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3978 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3978  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 318 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4771  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0325  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2509  AraC family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00177278  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  26.3 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1147  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17740  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  27.4 
 
 		 322 aa  90.5  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.743146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2321  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.612609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  23.76 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  34.53 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  40.23 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.2 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0100  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.42 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  34.09 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  28.09 
 
 		 497 aa  62.8  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6783  transcriptional regulator, AraC family  43.62 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0879  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000031891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  30 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  39.24 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  30.6 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  35.63 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5741  helix-turn-helix domain-containing protein  37.65 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2080  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  39.24 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  30.93 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.29 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 1349 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  31 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06729  hypothetical protein  34.41 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.95 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.42 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 436 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 506 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 326 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>