More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1150 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  55.2 
 
 		 621 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 602 aa  1229    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.59 
 
 		 596 aa  412  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.65 
 
 		 620 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  35.23 
 
 		 617 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  36.1 
 
 		 600 aa  327  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.66 
 
 		 622 aa  306  6e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.67 
 
 		 627 aa  298  2e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.61 
 
 		 621 aa  298  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.87 
 
 		 636 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  30.97 
 
 		 587 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  30.39 
 
 		 584 aa  247  6e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  29.93 
 
 		 583 aa  243  7.999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  31.09 
 
 		 584 aa  243  7.999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  31.34 
 
 		 583 aa  242  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  30.2 
 
 		 579 aa  233  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  30.59 
 
 		 585 aa  232  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  30.43 
 
 		 607 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  28.04 
 
 		 542 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.85 
 
 		 575 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  25.95 
 
 		 542 aa  170  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  26.45 
 
 		 536 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  34.45 
 
 		 551 aa  167  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.68 
 
 		 600 aa  167  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.21 
 
 		 544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.09 
 
 		 541 aa  164  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  26.13 
 
 		 531 aa  163  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.5 
 
 		 554 aa  163  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  26.67 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.86 
 
 		 543 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.54 
 
 		 567 aa  161  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.42 
 
 		 555 aa  160  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.16 
 
 		 553 aa  159  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.57 
 
 		 557 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.77 
 
 		 541 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  25.7 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.18 
 
 		 554 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.61 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.73 
 
 		 541 aa  157  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  27.45 
 
 		 559 aa  157  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  27.08 
 
 		 552 aa  156  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.17 
 
 		 581 aa  156  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.45 
 
 		 552 aa  157  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  26.83 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.63 
 
 		 578 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  27.57 
 
 		 566 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  24.69 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.23 
 
 		 552 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.8 
 
 		 582 aa  154  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.31 
 
 		 555 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.13 
 
 		 554 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.13 
 
 		 554 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.42 
 
 		 578 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.98 
 
 		 558 aa  153  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.98 
 
 		 558 aa  153  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.98 
 
 		 558 aa  153  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.73 
 
 		 563 aa  153  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  25.78 
 
 		 559 aa  153  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  25.16 
 
 		 617 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  25.47 
 
 		 553 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 		 540 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.05 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.82 
 
 		 555 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.21 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 553 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.59 
 
 		 550 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  24.8 
 
 		 592 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.59 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.59 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.59 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.59 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 553 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.21 
 
 		 560 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.72 
 
 		 552 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.72 
 
 		 552 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.21 
 
 		 560 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.21 
 
 		 560 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.5 
 
 		 623 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.39 
 
 		 608 aa  150  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.72 
 
 		 628 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  35.88 
 
 		 543 aa  150  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  33.02 
 
 		 540 aa  150  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  32.72 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  32.72 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  32.72 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.75 
 
 		 543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.38 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.72 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.72 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.72 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  26.9 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.72 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.13 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.72 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.72 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.77 
 
 		 632 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.26 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>