111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1084 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 333 aa  683    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  42.31 
 
 		 231 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  41.21 
 
 		 228 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  42.31 
 
 		 224 aa  143  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  39.04 
 
 		 240 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  34.33 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  36.15 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  36.15 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  32.66 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  31.09 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  27.55 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  33.85 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  38.24 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  35.04 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  32.41 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  27.37 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  35.34 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  34.07 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  35.79 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  29.44 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  34.11 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  32.06 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  34.09 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  35.86 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  37.11 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  35.17 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  35.85 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  35.94 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  35 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  34.86 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  35.24 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  35.24 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  26.94 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  33.33 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  34.74 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  31.88 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  34.68 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.92 
 
 		 153 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  39.36 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  34.48 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  34.29 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.81 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  33.02 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  37.62 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  34.62 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  33.33 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  31.88 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  29.38 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  38.61 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  27.78 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  31.3 
 
 		 178 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  28.29 
 
 		 214 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  32.56 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  28.29 
 
 		 214 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  29.49 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  34.27 
 
 		 170 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  31.62 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  31.15 
 
 		 166 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  30.08 
 
 		 171 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.09 
 
 		 171 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32.64 
 
 		 179 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  32.59 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  31.3 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  33.59 
 
 		 221 aa  52.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  34.62 
 
 		 153 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  34.88 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  35.38 
 
 		 171 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  32.19 
 
 		 190 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0781  nuclease (SNase-like)  37.86 
 
 		 114 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0368621  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  30.77 
 
 		 183 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  31.58 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  29.73 
 
 		 199 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  37.5 
 
 		 169 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.17 
 
 		 187 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  34.04 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  30 
 
 		 185 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  30.08 
 
 		 184 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.86 
 
 		 186 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  32.46 
 
 		 214 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  30.88 
 
 		 372 aa  49.7  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  33.1 
 
 		 191 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 158 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  30.37 
 
 		 166 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  37.63 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  28.46 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  32.08 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  34.95 
 
 		 160 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  34.74 
 
 		 155 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  29.87 
 
 		 534 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  30.66 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  31.63 
 
 		 124 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  28.86 
 
 		 227 aa  46.2  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  32.69 
 
 		 232 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  29.52 
 
 		 178 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  31.96 
 
 		 169 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  39.33 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 201 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  29.47 
 
 		 122 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  27.82 
 
 		 184 aa  44.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  32.35 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>