More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0175 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  100 
 
 		 553 aa  1142    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  47.4 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  40.08 
 
 		 482 aa  359  9e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  47.64 
 
 		 581 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  32.48 
 
 		 525 aa  206  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  32.41 
 
 		 534 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  31.28 
 
 		 488 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  33 
 
 		 718 aa  186  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  34.09 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  29.4 
 
 		 485 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  32.02 
 
 		 530 aa  183  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  33.33 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  30.18 
 
 		 498 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  31.94 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  29.98 
 
 		 486 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  30.04 
 
 		 485 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  29.48 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  30.44 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  30.08 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  30.39 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  30.3 
 
 		 451 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  31.43 
 
 		 476 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  31.62 
 
 		 479 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  32.51 
 
 		 480 aa  177  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  31.85 
 
 		 501 aa  177  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  30.69 
 
 		 449 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  32.51 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  29.52 
 
 		 490 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  33.41 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  31.72 
 
 		 494 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  35.09 
 
 		 493 aa  171  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 		 482 aa  170  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  32.37 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  32.29 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  31.62 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  31.95 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  31.95 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  31.95 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  29.52 
 
 		 476 aa  169  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  31.86 
 
 		 457 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  31.62 
 
 		 478 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  31.95 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  31.54 
 
 		 514 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  31.54 
 
 		 514 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  31.54 
 
 		 514 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  31.54 
 
 		 514 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  32.13 
 
 		 518 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  31.37 
 
 		 478 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  31.82 
 
 		 518 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  31.82 
 
 		 518 aa  166  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  33.66 
 
 		 457 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  31.82 
 
 		 518 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  31.7 
 
 		 472 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  35 
 
 		 508 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  40.46 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  40.46 
 
 		 472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  31.82 
 
 		 518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  37.1 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  39.27 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  40.46 
 
 		 518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  31.29 
 
 		 486 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  31.29 
 
 		 486 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  31.29 
 
 		 513 aa  164  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  30.14 
 
 		 477 aa  163  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  37.5 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  37.96 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 523 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  36.17 
 
 		 508 aa  159  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  29.7 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  29.53 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  28.88 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  29.73 
 
 		 528 aa  157  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 470 aa  157  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  31.05 
 
 		 523 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  31.45 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  27.18 
 
 		 518 aa  153  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  30.68 
 
 		 437 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  28.89 
 
 		 478 aa  150  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  28.29 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  27.5 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.1 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  34.23 
 
 		 402 aa  108  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  26.09 
 
 		 714 aa  108  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  34.23 
 
 		 402 aa  108  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  27.23 
 
 		 485 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  33.78 
 
 		 410 aa  100  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 464 aa  98.2  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  46.53 
 
 		 196 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  26.07 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  42.97 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  28.04 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  42.57 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  42.57 
 
 		 197 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  23.43 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  25.13 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  40.59 
 
 		 224 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 261 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  29.58 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>