98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2658 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  55.04 
 
 
700 aa  797    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  71.39 
 
 
714 aa  1051    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  71.89 
 
 
714 aa  1054    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 
709 aa  1452    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  92.1 
 
 
709 aa  1350    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  71.23 
 
 
707 aa  1061    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  70.06 
 
 
708 aa  1047    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  60.17 
 
 
708 aa  901    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  60.17 
 
 
708 aa  901    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  70.06 
 
 
708 aa  1047    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  60.03 
 
 
708 aa  899    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  46.99 
 
 
722 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  42.07 
 
 
718 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  41.37 
 
 
735 aa  538  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  42.11 
 
 
723 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  42.11 
 
 
736 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  41.84 
 
 
724 aa  535  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  41.25 
 
 
727 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  42.71 
 
 
721 aa  530  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  44.63 
 
 
715 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  44.64 
 
 
728 aa  521  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  44.22 
 
 
747 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  42.94 
 
 
733 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  42.67 
 
 
724 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  41.54 
 
 
704 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  41.23 
 
 
726 aa  484  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  42.81 
 
 
730 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  40.66 
 
 
718 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  41.06 
 
 
740 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  41.55 
 
 
707 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  41.82 
 
 
701 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.34 
 
 
719 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  40.34 
 
 
723 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  40.14 
 
 
747 aa  449  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  39.59 
 
 
733 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.5 
 
 
699 aa  422  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.19 
 
 
688 aa  402  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  37.04 
 
 
768 aa  383  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  34.45 
 
 
729 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  32.15 
 
 
729 aa  331  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.97 
 
 
733 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  31.08 
 
 
726 aa  326  8.000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  32.47 
 
 
739 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  34.24 
 
 
734 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  34.82 
 
 
729 aa  318  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  33.46 
 
 
740 aa  317  7e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  33.66 
 
 
730 aa  316  9e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  32.8 
 
 
750 aa  310  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  34.73 
 
 
726 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  31.91 
 
 
722 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  33.91 
 
 
818 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  36.03 
 
 
699 aa  301  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  32.69 
 
 
729 aa  299  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  35.32 
 
 
734 aa  296  8e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  33.23 
 
 
716 aa  291  3e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  31.38 
 
 
774 aa  290  9e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  34.61 
 
 
701 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.8 
 
 
729 aa  286  9e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  29.1 
 
 
743 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  34.57 
 
 
713 aa  285  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  31.74 
 
 
713 aa  270  5e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  29.9 
 
 
730 aa  256  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  27.24 
 
 
726 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  30.66 
 
 
727 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  29.98 
 
 
684 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  31.9 
 
 
657 aa  130  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  30.43 
 
 
530 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.87 
 
 
683 aa  111  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  26.88 
 
 
669 aa  103  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  28.57 
 
 
706 aa  98.2  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  25.05 
 
 
675 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  26.06 
 
 
723 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.11 
 
 
674 aa  87.8  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  22.86 
 
 
700 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  24.55 
 
 
732 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  25.82 
 
 
579 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  29.45 
 
 
579 aa  72  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  26.44 
 
 
679 aa  68.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  26.88 
 
 
562 aa  61.6  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  29.77 
 
 
578 aa  61.2  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  30.81 
 
 
527 aa  61.2  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  25.83 
 
 
505 aa  60.1  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  28.96 
 
 
589 aa  57.4  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  28.79 
 
 
484 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  24.81 
 
 
502 aa  55.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  29.75 
 
 
1020 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  33.08 
 
 
782 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.77 
 
 
824 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  22.11 
 
 
430 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  22.5 
 
 
679 aa  52  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1712  glycoside hydrolase family 31  24.75 
 
 
533 aa  50.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000051017  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  36 
 
 
429 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  29.66 
 
 
552 aa  50.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  29.66 
 
 
552 aa  50.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  20 
 
 
579 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  34.72 
 
 
700 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.46 
 
 
510 aa  45.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  22.73 
 
 
694 aa  44.3  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>