201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1712 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1712  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 		 533 aa  1058    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000051017  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1770  glycoside hydrolase family 31  64.8 
 
 		 515 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.134766  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  38.39 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  40.53 
 
 		 527 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  36.84 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  36.87 
 
 		 631 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  34.34 
 
 		 616 aa  227  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38421  predicted protein  33.92 
 
 		 559 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452022  hitchhiker  0.000596343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  32.66 
 
 		 765 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  30.28 
 
 		 760 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  30.63 
 
 		 765 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  23.52 
 
 		 712 aa  129  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  28.07 
 
 		 749 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  27.97 
 
 		 775 aa  128  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  26.57 
 
 		 681 aa  126  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  25.95 
 
 		 774 aa  126  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  27.68 
 
 		 779 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  23.69 
 
 		 772 aa  123  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  27.2 
 
 		 804 aa  120  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  26.48 
 
 		 775 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  23.46 
 
 		 752 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  23.17 
 
 		 770 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  26.01 
 
 		 760 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  28.96 
 
 		 763 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  26.35 
 
 		 771 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  24.2 
 
 		 780 aa  114  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  26.21 
 
 		 777 aa  113  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  24.94 
 
 		 764 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  22.88 
 
 		 775 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  24.94 
 
 		 764 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  28.04 
 
 		 770 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  24.57 
 
 		 772 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  25.44 
 
 		 661 aa  110  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  24.77 
 
 		 757 aa  110  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  24.57 
 
 		 772 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  24.57 
 
 		 772 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  24.51 
 
 		 772 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  24.78 
 
 		 772 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  23.08 
 
 		 772 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  23.08 
 
 		 772 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  26.19 
 
 		 780 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  23.08 
 
 		 772 aa  108  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  23.08 
 
 		 772 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  23.53 
 
 		 772 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  22.97 
 
 		 763 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  23.53 
 
 		 772 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  26.45 
 
 		 779 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  24.67 
 
 		 772 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 		 799 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  23.53 
 
 		 772 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  23.17 
 
 		 772 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  26.8 
 
 		 806 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.6 
 
 		 766 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  25.89 
 
 		 815 aa  103  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  28.99 
 
 		 825 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  23.6 
 
 		 821 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  23.55 
 
 		 679 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  23.55 
 
 		 679 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  24.49 
 
 		 760 aa  99.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.32 
 
 		 828 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  23.55 
 
 		 679 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  22.06 
 
 		 799 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  23.36 
 
 		 679 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  25.81 
 
 		 823 aa  97.4  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  23.36 
 
 		 679 aa  97.8  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.8 
 
 		 690 aa  97.1  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.93 
 
 		 779 aa  97.1  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  22.27 
 
 		 668 aa  96.3  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 699 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 784 aa  95.9  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  25.4 
 
 		 656 aa  95.1  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  26.07 
 
 		 816 aa  95.1  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  22.24 
 
 		 679 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  24.39 
 
 		 806 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  24.13 
 
 		 797 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5324  alpha-glucosidase  24.39 
 
 		 678 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  27.56 
 
 		 695 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  24.15 
 
 		 678 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1145  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 		 739 aa  92.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  24.15 
 
 		 678 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  24.15 
 
 		 678 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  23.9 
 
 		 667 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1663  alpha-glucosidase  26.46 
 
 		 681 aa  89.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  24.06 
 
 		 795 aa  89.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  23.9 
 
 		 654 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  25.31 
 
 		 803 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2586  alpha-glucosidase  26.73 
 
 		 738 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4229  alpha-glucosidase  24.56 
 
 		 678 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  23.99 
 
 		 839 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  25.14 
 
 		 794 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4341  alpha-glucosidase  24.2 
 
 		 678 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4407  alpha-glucosidase  24.2 
 
 		 678 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4250  alpha-glucosidase  24.2 
 
 		 678 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  24.48 
 
 		 687 aa  87.8  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4295  alpha-glucosidase  24.2 
 
 		 678 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  23.65 
 
 		 752 aa  87.4  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  24.76 
 
 		 836 aa  87  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  22.6 
 
 		 792 aa  87  8e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.16 
 
 		 788 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  27.61 
 
 		 828 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>