187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1770 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1770  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 
515 aa  1032    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.134766  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1712  glycoside hydrolase family 31  64.8 
 
 
533 aa  648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000051017  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  38.75 
 
 
502 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  39.89 
 
 
527 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  36.47 
 
 
631 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  35.66 
 
 
430 aa  223  8e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  31.7 
 
 
616 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38421  predicted protein  35.4 
 
 
559 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452022  hitchhiker  0.000596343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  30.66 
 
 
760 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  30.1 
 
 
765 aa  136  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  29.92 
 
 
765 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  27.79 
 
 
681 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  27.12 
 
 
749 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  26.75 
 
 
777 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  25.82 
 
 
757 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  27.43 
 
 
779 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  24.52 
 
 
752 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  25.99 
 
 
779 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  26.24 
 
 
775 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  26.12 
 
 
771 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  26.01 
 
 
804 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  30.68 
 
 
828 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  26.89 
 
 
656 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  29.38 
 
 
763 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  25.91 
 
 
760 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  26.07 
 
 
794 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  24.34 
 
 
712 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 
799 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  25.27 
 
 
770 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  24.57 
 
 
774 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  25.1 
 
 
772 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 
778 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  27.71 
 
 
772 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  24.01 
 
 
772 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  24.24 
 
 
795 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  27.56 
 
 
770 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  25.42 
 
 
772 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  25.42 
 
 
772 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  25.21 
 
 
772 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  25.42 
 
 
772 aa  101  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  25.21 
 
 
772 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  25.42 
 
 
772 aa  101  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  25.13 
 
 
815 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  25.21 
 
 
772 aa  100  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.65 
 
 
690 aa  100  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  24.36 
 
 
760 aa  100  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  28.31 
 
 
825 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  24.74 
 
 
772 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  24.8 
 
 
763 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  24.63 
 
 
764 aa  99  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  24.74 
 
 
772 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.1 
 
 
828 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  24.74 
 
 
772 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  24.74 
 
 
772 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  24.63 
 
 
764 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  24.66 
 
 
775 aa  97.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  27.11 
 
 
779 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  26.91 
 
 
775 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  24.66 
 
 
699 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  27.23 
 
 
803 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.13 
 
 
766 aa  95.9  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  23.78 
 
 
772 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  22.53 
 
 
679 aa  94.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  22.53 
 
 
679 aa  94.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  22.73 
 
 
679 aa  94.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  21.65 
 
 
668 aa  94  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  22.53 
 
 
679 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  24.84 
 
 
687 aa  93.2  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  22.96 
 
 
679 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  22.53 
 
 
679 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  22.99 
 
 
780 aa  91.3  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  22.52 
 
 
839 aa  90.9  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  26.5 
 
 
806 aa  90.5  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2586  alpha-glucosidase  26.4 
 
 
738 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  23.34 
 
 
836 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  24.79 
 
 
780 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  24.56 
 
 
797 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  24.02 
 
 
799 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5324  alpha-glucosidase  24.7 
 
 
678 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.539055 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  23.78 
 
 
661 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  25.06 
 
 
695 aa  87.4  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  24.4 
 
 
678 aa  87  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  24.4 
 
 
678 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  24.4 
 
 
678 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4630  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 
744 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  26.23 
 
 
685 aa  85.9  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  24.11 
 
 
667 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  25.88 
 
 
695 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  24.11 
 
 
654 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  22.72 
 
 
743 aa  84  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  26.4 
 
 
806 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  26.53 
 
 
683 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  24.56 
 
 
700 aa  82  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
806 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
806 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  23.84 
 
 
823 aa  82.4  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 
784 aa  82.4  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  25.83 
 
 
803 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  24.93 
 
 
779 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  25.18 
 
 
806 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>