260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2503 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2503  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.39 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.61 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1948  tetratricopeptide domain-containing protein  34.05 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.746225  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1473  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00324934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.16 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0241049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1801  Tetratricopeptide repeat protein  29.46 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1005 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2672  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.03 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.03 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.77 
 
 		 1034 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 543 aa  58.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 687 aa  58.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 		 689 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 4079 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2363  hypothetical protein  28.77 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  35.42 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  35.42 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 3035 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  34.38 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 750 aa  55.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  34.38 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 804 aa  56.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  34.38 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1276 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.01 
 
 		 1694 aa  55.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 499 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.76 
 
 		 397 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 402 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  21.71 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  29.55 
 
 		 309 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 352 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 393 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 356 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 4489 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1138 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 927 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28.06 
 
 		 349 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  26.19 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.12 
 
 		 1979 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 1094 aa  51.6  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 		 632 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 319 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0740  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.773618 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 602 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.66 
 
 		 887 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.45 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  36.25 
 
 		 452 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.23 
 
 		 576 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 332 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.58 
 
 		 810 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 534 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  27.49 
 
 		 444 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.44 
 
 		 758 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 366 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 357 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  25.23 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 344 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  24.03 
 
 		 299 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1121 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 409 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 629 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.35 
 
 		 622 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 3560 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 605 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 247 aa  48.5  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 715 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.35 
 
 		 764 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.6 
 
 		 1013 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.58 
 
 		 458 aa  48.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 878 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 573 aa  48.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 363 aa  48.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  22.14 
 
 		 564 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 393 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1069 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.7 
 
 		 573 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.83 
 
 		 839 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.6 
 
 		 471 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>