19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2363 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2363  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1948  tetratricopeptide domain-containing protein  43.5 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.746225  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.02 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1473  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00324934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2503  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1801  Tetratricopeptide repeat protein  28.46 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0241049 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3287  Tetratricopeptide domain protein  24.62 
 
 		 348 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.24526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 505 aa  45.1  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 598 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.19 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 448 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 619 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 748 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.71 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 595 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 351 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>