35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1473 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1473  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00324934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47 
 
 		 206 aa  177  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1948  tetratricopeptide domain-containing protein  50 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.746225  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.37 
 
 		 187 aa  117  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2363  hypothetical protein  36.81 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2503  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.86 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0241049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1801  Tetratricopeptide repeat protein  30.37 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  41.1 
 
 		 681 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1142  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 331 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  29.69 
 
 		 417 aa  48.5  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 553 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  33.33 
 
 		 603 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0482  hypothetical protein  25.76 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.62875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.07 
 
 		 882 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 634 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 		 594 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 931 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 572 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 621 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  29.11 
 
 		 1004 aa  43.9  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  30.88 
 
 		 111 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 357 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.78 
 
 		 882 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 357 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2170  tetratricopeptide TPR_2  27.72 
 
 		 446 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 291 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 599 aa  42  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 207 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  28.68 
 
 		 592 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  36.47 
 
 		 428 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.47 
 
 		 426 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  36.47 
 
 		 433 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>