More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0426 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0426  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 356 aa  724    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  49.16 
 
 		 400 aa  315  5e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  49.43 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  48.75 
 
 		 398 aa  312  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  46.61 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  46.87 
 
 		 469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  45.85 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  46.57 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  45.13 
 
 		 389 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  46.27 
 
 		 396 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  46.02 
 
 		 398 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  44.84 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  46.11 
 
 		 389 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  46.2 
 
 		 395 aa  295  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  45.97 
 
 		 395 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  46.63 
 
 		 418 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  45.24 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  44.97 
 
 		 388 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  45.1 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  44.85 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  46.84 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  44.97 
 
 		 385 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  45.45 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  41.94 
 
 		 407 aa  289  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  43.43 
 
 		 388 aa  288  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  46.7 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  46.7 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  48.61 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  44.41 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  45.35 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  43.8 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  47.62 
 
 		 388 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  41.16 
 
 		 440 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  41.16 
 
 		 395 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  42.18 
 
 		 411 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  41.16 
 
 		 395 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  41.16 
 
 		 395 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  40.88 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  40.88 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  40.88 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  44.61 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  41.67 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  44.35 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  40.88 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  42.56 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  44.03 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  41.16 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  42.77 
 
 		 389 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  43.26 
 
 		 415 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  46.76 
 
 		 388 aa  282  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  41.16 
 
 		 395 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  41.16 
 
 		 395 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  42.73 
 
 		 396 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  41.16 
 
 		 395 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  41.44 
 
 		 395 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  45.18 
 
 		 416 aa  281  8.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  44.05 
 
 		 393 aa  281  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  42.49 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  44.18 
 
 		 396 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  44.05 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  42.26 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  45.27 
 
 		 407 aa  279  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  45.45 
 
 		 395 aa  279  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  41.57 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 		 396 aa  276  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  41.9 
 
 		 399 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0925  cystathionine beta-lyase  39.89 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  41.29 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  41.62 
 
 		 399 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  42.64 
 
 		 388 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  44.23 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1884  cystathionine beta-lyase  45.29 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  41.34 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  41.34 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  42.62 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  43.2 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  40.56 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  41.5 
 
 		 399 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  41.5 
 
 		 399 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  41.5 
 
 		 399 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  44.54 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  44.07 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  41.06 
 
 		 399 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  41.23 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  43.24 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  44.71 
 
 		 417 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  42.06 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  42.42 
 
 		 896 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  43.62 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0540  cystathionine beta-lyase  39.67 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.144132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  40.22 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  40.22 
 
 		 403 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0384  cystathionine beta-lyase  40.22 
 
 		 396 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.782628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  43.03 
 
 		 400 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0341  cystathionine beta-lyase  40.5 
 
 		 396 aa  262  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  41.14 
 
 		 400 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  39.5 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>