More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2892 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  100 
 
 		 377 aa  768    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  45.87 
 
 		 363 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  39.43 
 
 		 432 aa  252  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  33.54 
 
 		 423 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  34.28 
 
 		 454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  32.93 
 
 		 388 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  35.61 
 
 		 252 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.79 
 
 		 247 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  28.4 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  30.58 
 
 		 230 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  27.11 
 
 		 931 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  26.13 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  25.81 
 
 		 530 aa  73.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  38 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  28.14 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  47.69 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  26.69 
 
 		 523 aa  69.7  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  23.96 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  25.08 
 
 		 529 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  30.81 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  25.42 
 
 		 529 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  24.22 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  33.87 
 
 		 173 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  25.18 
 
 		 896 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  49.23 
 
 		 127 aa  65.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  34.45 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  44.32 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  26.6 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  43.04 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  48.53 
 
 		 145 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 173 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  42.67 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 		 137 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 174 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  49.06 
 
 		 189 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  43.06 
 
 		 114 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  48.21 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  43.06 
 
 		 110 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  39.71 
 
 		 118 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  23.96 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  24.74 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  23.61 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  23.94 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.43 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  24.18 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  30.58 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  42.37 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.9 
 
 		 566 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  24.26 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 137 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 112 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 218 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  32.67 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 142 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 		 167 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  23.83 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  48.28 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.56 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.67 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  47.17 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  32.22 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.88 
 
 		 107 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.67 
 
 		 116 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  36.46 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  45.61 
 
 		 101 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  33.86 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16570  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  50 
 
 		 563 aa  57  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0975833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  37.68 
 
 		 152 aa  57  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.43 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  43.06 
 
 		 480 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  45.45 
 
 		 820 aa  57  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  25.55 
 
 		 528 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 177 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  26.78 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  34.04 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  50.94 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.68 
 
 		 123 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>