More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1163 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  61.01 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 159 aa  190  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.54 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.3 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 172 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  31.34 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  22.79 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  31.51 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 193 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 206 aa  47.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  25 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  30.43 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  29.81 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 181 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  23.65 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.2 
 
 		 349 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>