94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4684 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 328 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  58.77 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  53.66 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  53.35 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  53.35 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  56.79 
 
 		 328 aa  348  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  54.63 
 
 		 316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  55.86 
 
 		 332 aa  338  8e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  37.61 
 
 		 336 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  37.26 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  36.62 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  37.34 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  35.47 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  30.29 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  30 
 
 		 342 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  34.06 
 
 		 335 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  27.46 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  27.93 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  27.71 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  27.33 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  34.77 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  28.18 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  24.59 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  26.95 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  29.46 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.78 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.3 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  23.49 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  28.88 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.69 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.15 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  24.29 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  27.48 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  24.76 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  28.8 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.63 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.24 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.24 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  23.58 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.24 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.24 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.02 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  25.55 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.55 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.55 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.55 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.55 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  28.24 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  30.11 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.36 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  23.76 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  26.2 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  27.04 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  27.04 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  30.65 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  28.29 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.8 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.2 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  26.27 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.7 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  22.18 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  26.77 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  30.95 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  30.95 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  30.37 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  29.65 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  21.48 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  25.77 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  26.1 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.75 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  26.95 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  27.06 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.69 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  23.96 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  22.86 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  24.6 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  26.92 
 
 		 389 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0670  DNA polymerase III delta  21.76 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.840892  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  26.19 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  22.55 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  18.99 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0767  DNA polymerase III, delta subunit  24.36 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0743  DNA polymerase III, delta subunit  24.36 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  28.76 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  23.64 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  25.1 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  30.82 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  24.21 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  28.27 
 
 		 346 aa  42.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>