More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0098 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0098  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 253 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00697344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4220  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0173  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5271  transcriptional regulator, LuxR family  35.83 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1136  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  52.73 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5158  transcriptional regulator, LuxR family  27.33 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00149525  decreased coverage  0.000111139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  58 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1382  two component LuxR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.32 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.88 
 
 		 205 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1632  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  45.45 
 
 		 921 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  44.26 
 
 		 896 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1045  regulatory protein LuxR  29.11 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  40 
 
 		 933 aa  52.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0536  transcriptional regulator, LuxR family  26.77 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 272 aa  52  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 226 aa  52  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4126  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  44 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  46.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  47.27 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3175  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  47.27 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  50.98 
 
 		 896 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  44.83 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  35.79 
 
 		 574 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  50.91 
 
 		 1006 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  45.9 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  33.82 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0293  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  31.87 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 363 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3683  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00690698  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2062  LuxR family DNA-binding response regulator  48.94 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0766  DNA-binding response regulator  48.94 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>