More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0907 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  52.17 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  52.66 
 
 		 222 aa  217  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  51.69 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  52.15 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  42.25 
 
 		 187 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  38.36 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  39.62 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  34.62 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  34.95 
 
 		 335 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  34.34 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  40.88 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  34.95 
 
 		 317 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  33.97 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  35.78 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  33 
 
 		 312 aa  129  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  35.75 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  35.35 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  34.52 
 
 		 304 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  34.55 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  33.78 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  32.21 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  32.21 
 
 		 211 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  32.69 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  34.2 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  35.1 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  32.46 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  32.14 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  24.02 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  24.76 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437402 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  24.75 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  26.54 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  24.06 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  33.9 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2058  30S ribosomal protein S3  32.62 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00124748  normal  0.255543 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0187  30S ribosomal protein S3  30.5 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000114695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0391  30S ribosomal protein S3  32.84 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  27.56 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  30.51 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2417  30S ribosomal protein S3  31.21 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000314718  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0809  30S ribosomal protein S3  30.88 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.232608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0295  30S ribosomal protein S3  33.33 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2613  30S ribosomal protein S3  29.66 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00358822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2223  30S ribosomal protein S3  32.48 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000780693  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  28.12 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  30.15 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1153  30S ribosomal protein S3  29.66 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000018962  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1845  30S ribosomal protein S3  33.62 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.478423  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  30.2 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0344  30S ribosomal protein S3  30.15 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.212701  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1270  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00251085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0279  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000626052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1155  ribosomal protein S3  30.43 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000113812  hitchhiker  0.0000354115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0397  30S ribosomal protein S3  28.68 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  30.43 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0284  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128971  hitchhiker  0.0000000454249 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1869  30S ribosomal protein S3  28.21 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.437759  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1698  30S ribosomal protein S3  28.21 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141955  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  34.75 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  32.37 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  33.9 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0209  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_002950  PG1932  30S ribosomal protein S3  27.33 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2075  30S ribosomal protein S3  28.21 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000597186  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  32.87 
 
 		 267 aa  53.1  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  30.43 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  30.43 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  30.43 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  30.43 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  31.39 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  28.68 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  29.71 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2812  30S ribosomal protein S3  27.55 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  29.03 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0262  30S ribosomal protein S3  28.68 
 
 		 301 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3789  30S ribosomal protein S3  28.68 
 
 		 298 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.461405  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0056  ribosomal protein S3  28.41 
 
 		 271 aa  52.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000180668  hitchhiker  1.0517300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1191  30S ribosomal protein S3  32.85 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23750  SSU ribosomal protein S3P  32.2 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.167158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  30.25 
 
 		 278 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  26.28 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  31.36 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  31.36 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09940  SSU ribosomal protein S3P  29.41 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.257564  hitchhiker  0.00000258289 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17100  SSU ribosomal protein S3P  29.05 
 
 		 272 aa  51.6  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0525637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  31.09 
 
 		 221 aa  52  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  28.3 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  28.68 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05745  putative 30S ribosomal protein S3  29.66 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0959126  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  36.49 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  29.81 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  29.5 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>