More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1834 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  100 
 
 
317 aa  612  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  91.78 
 
 
326 aa  403  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  86.54 
 
 
317 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  87.32 
 
 
335 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  66.13 
 
 
312 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  62.56 
 
 
276 aa  268  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  58.97 
 
 
234 aa  267  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  58.88 
 
 
234 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  57.95 
 
 
231 aa  263  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  57.44 
 
 
237 aa  259  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  53.3 
 
 
304 aa  257  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  57 
 
 
311 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  53.54 
 
 
231 aa  252  7e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  47.64 
 
 
237 aa  225  9e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  45.75 
 
 
208 aa  215  7e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  47.29 
 
 
211 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  47.29 
 
 
211 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  46.8 
 
 
211 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  47.4 
 
 
211 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  39.62 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  48.33 
 
 
187 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  41.76 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  35.9 
 
 
251 aa  142  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  34.65 
 
 
217 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  35.05 
 
 
220 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  35.57 
 
 
224 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  32.19 
 
 
236 aa  133  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  34.33 
 
 
222 aa  132  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.44 
 
 
231 aa  126  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  31.25 
 
 
252 aa  123  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  32.52 
 
 
242 aa  123  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0437402 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  31.75 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  31.38 
 
 
253 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  34.1 
 
 
250 aa  93.2  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  30.57 
 
 
222 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  30.57 
 
 
222 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 
248 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2613  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 
253 aa  89.7  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00358822  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  30.57 
 
 
226 aa  86.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0432  30S ribosomal protein S3  31.15 
 
 
247 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392005  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  31.49 
 
 
213 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  32.14 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  29.23 
 
 
221 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  32.39 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  32.16 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  30.57 
 
 
226 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  30.05 
 
 
219 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  27.96 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0495  30S ribosomal protein S3  30.6 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000115275  hitchhiker  0.00400345 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  30.77 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  28.27 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0490  30S ribosomal protein S3  30.6 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000127993  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  28.42 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  29.79 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  27.72 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  28.42 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  28.42 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  31.35 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  31.44 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  34.15 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  31.25 
 
 
218 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0334  ribosomal protein S3  27.47 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.385043  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  28.49 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  28.96 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  28.96 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  28.99 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  28.96 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  31.25 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  28.96 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  28.99 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1846  30S ribosomal protein S3  29.07 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00843492  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  32 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  28.99 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0397  30S ribosomal protein S3  25.71 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  29.03 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  29.02 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  28.99 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  27.96 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  27.87 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_002620  TC0809  30S ribosomal protein S3  29.28 
 
 
224 aa  77  0.0000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.232608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  28.57 
 
 
220 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  28.99 
 
 
228 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  29.55 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  27.91 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  29.84 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  28.4 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>