More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0216 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  100 
 
 		 335 aa  639    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  96.26 
 
 		 317 aa  425  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  68.06 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  67.09 
 
 		 312 aa  378  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  82.96 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  63.27 
 
 		 276 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  55.41 
 
 		 304 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  57.92 
 
 		 234 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  53.31 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  55.61 
 
 		 234 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  56.92 
 
 		 231 aa  265  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  56.41 
 
 		 237 aa  256  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  54.04 
 
 		 231 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  48.48 
 
 		 237 aa  222  8e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  47.4 
 
 		 208 aa  210  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  46.88 
 
 		 211 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  46.88 
 
 		 211 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  46.35 
 
 		 211 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  47.4 
 
 		 211 aa  199  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  49.44 
 
 		 187 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  39.81 
 
 		 229 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  42.86 
 
 		 240 aa  173  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  33.48 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  35 
 
 		 220 aa  136  4e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  34 
 
 		 217 aa  135  8e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  35.71 
 
 		 251 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  34.5 
 
 		 224 aa  133  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  34.5 
 
 		 222 aa  130  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  31.63 
 
 		 231 aa  123  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  32.09 
 
 		 242 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437402 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  30.29 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  30.37 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  29.41 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  35.84 
 
 		 250 aa  99.4  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  32.43 
 
 		 222 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  32.43 
 
 		 222 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2613  30S ribosomal protein S3  33.93 
 
 		 253 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00358822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  35.12 
 
 		 249 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  30.77 
 
 		 248 aa  89.7  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  32.6 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0432  30S ribosomal protein S3  31.15 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392005  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  31.35 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  32.74 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  30.43 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  31.19 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0809  30S ribosomal protein S3  30.95 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.232608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  28.72 
 
 		 221 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  30.36 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  32.43 
 
 		 221 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  32.16 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  31.58 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  29.51 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  32.93 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  30.99 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  31.87 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  29.89 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0495  30S ribosomal protein S3  30.05 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000115275  hitchhiker  0.00400345 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  30.36 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  33.33 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf436  30S ribosomal protein S3  30.81 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  29.59 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0490  30S ribosomal protein S3  30.05 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000127993  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2149  SSU ribosomal protein S3P  32.37 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0519385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  32.16 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  30.94 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 228 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  30.77 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  29.59 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  30.77 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1388  ribosomal protein S3  32.65 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000147374  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  31.36 
 
 		 231 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  27.87 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1298  ribosomal protein S3  32.65 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000309982  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  31.72 
 
 		 238 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 228 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  29.51 
 
 		 230 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  30.05 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  27.81 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  30.77 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  31.98 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  30.77 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1846  30S ribosomal protein S3  28.99 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00843492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  29.59 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  30.72 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_002950  PG1932  30S ribosomal protein S3  29.61 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3013  30S ribosomal protein S3  28.14 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000335081  decreased coverage  0.002387 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  28.99 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  28.99 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  30.72 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2944  30S ribosomal protein S3  28.14 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012288  decreased coverage  0.000000133007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  30.77 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  27.87 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  28.99 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  30.72 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>