More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1901 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  100 
 
 
217 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  95.39 
 
 
217 aa  421  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  88.94 
 
 
217 aa  397  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  76.92 
 
 
221 aa  356  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  78.9 
 
 
218 aa  348  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  77.52 
 
 
218 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  338  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  73.97 
 
 
219 aa  333  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  73.97 
 
 
219 aa  333  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  73.97 
 
 
219 aa  333  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  73.97 
 
 
219 aa  333  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  73.97 
 
 
219 aa  333  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  73.97 
 
 
219 aa  333  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  73.97 
 
 
219 aa  333  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  74.43 
 
 
219 aa  333  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  73.97 
 
 
219 aa  333  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  73.97 
 
 
219 aa  333  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 
217 aa  332  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 
217 aa  332  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  72.81 
 
 
217 aa  331  6e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  71.95 
 
 
222 aa  328  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  72.09 
 
 
226 aa  325  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  69.51 
 
 
223 aa  307  9e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  64.38 
 
 
219 aa  298  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  65.74 
 
 
219 aa  297  9e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  65.14 
 
 
226 aa  292  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  63.76 
 
 
221 aa  290  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  63.3 
 
 
218 aa  286  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  63.64 
 
 
220 aa  284  7e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  64.11 
 
 
214 aa  284  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  62.02 
 
 
229 aa  281  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  63.68 
 
 
222 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  65.88 
 
 
220 aa  280  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  62.91 
 
 
238 aa  277  8e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  63.38 
 
 
267 aa  276  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  60.65 
 
 
219 aa  275  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  61.97 
 
 
222 aa  272  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  61.97 
 
 
222 aa  272  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  60.66 
 
 
262 aa  271  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  61.36 
 
 
222 aa  270  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  58.65 
 
 
224 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  58.65 
 
 
224 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  58.65 
 
 
224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  60.58 
 
 
395 aa  268  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  59.24 
 
 
260 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  59.81 
 
 
241 aa  266  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 
210 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  56.4 
 
 
211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  57.69 
 
 
224 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  56.87 
 
 
211 aa  264  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  59.42 
 
 
223 aa  263  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 
211 aa  263  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  57.14 
 
 
302 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 
211 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  60.66 
 
 
228 aa  262  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  62.98 
 
 
228 aa  262  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 
228 aa  262  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  57.62 
 
 
210 aa  261  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  57.28 
 
 
278 aa  261  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 
230 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  58.37 
 
 
221 aa  260  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  56.67 
 
 
210 aa  260  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  60.56 
 
 
228 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  60.56 
 
 
228 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  60.09 
 
 
228 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  60.09 
 
 
228 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  60.09 
 
 
228 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 
224 aa  258  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  56.19 
 
 
272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 
233 aa  258  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  60.58 
 
 
226 aa  256  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 
226 aa  257  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 
223 aa  256  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 
229 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  54.93 
 
 
275 aa  256  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  57.42 
 
 
230 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 
232 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 
232 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 
232 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 
227 aa  256  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 
232 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  54.03 
 
 
223 aa  255  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
232 aa  255  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 
228 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 
228 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 
228 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0457  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 
278 aa  255  4e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991742  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 
235 aa  255  4e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 
228 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  56.74 
 
 
234 aa  254  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_423  ribosomal protein S3  58.22 
 
 
278 aa  254  5e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652723  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0480  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 
278 aa  254  7e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 
233 aa  254  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 
233 aa  254  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  57.97 
 
 
249 aa  254  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 
229 aa  254  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 
232 aa  254  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 
229 aa  254  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 
232 aa  254  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001736  SSU ribosomal protein S3p (S3e)  58.17 
 
 
232 aa  254  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000123717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>