More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2901 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2613  30S ribosomal protein S3  85.19 
 
 		 253 aa  384  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00358822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  66.36 
 
 		 248 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  52.89 
 
 		 221 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  51.93 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  54.42 
 
 		 219 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  52.07 
 
 		 220 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  54.42 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  54.46 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 238 aa  234  7e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  52.07 
 
 		 226 aa  234  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  51.54 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  51.08 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  57 
 
 		 223 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  51.93 
 
 		 231 aa  232  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  50 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  52.14 
 
 		 232 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 219 aa  231  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  50.46 
 
 		 222 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  51.71 
 
 		 232 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  51.05 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  51.71 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  51.5 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  52.27 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  52.27 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  51.98 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  51.17 
 
 		 211 aa  228  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  48.96 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  51.17 
 
 		 211 aa  228  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 236 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  52.11 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  52.94 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  49.37 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  49.37 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  50.64 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0262  30S ribosomal protein S3  45.45 
 
 		 301 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 221 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  50.94 
 
 		 210 aa  225  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  49.55 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 237 aa  225  6e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 228 aa  225  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 249 aa  225  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 224 aa  225  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 243 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  48.66 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  49.55 
 
 		 228 aa  224  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  49.76 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  51.21 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  49.76 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0209  30S ribosomal protein S3  46.18 
 
 		 295 aa  221  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  47.46 
 
 		 241 aa  222  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  48.31 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  52.66 
 
 		 241 aa  221  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  49.11 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  49.11 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  49.11 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  49.11 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  51.69 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  48.93 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  48.21 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  48.21 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  48.21 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  51.58 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  47.73 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1347  30S ribosomal protein S3  51.16 
 
 		 231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  50 
 
 		 216 aa  218  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  48.66 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  50.72 
 
 		 214 aa  218  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>