More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1179 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  100 
 
 		 262 aa  526  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  92.05 
 
 		 260 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  74.6 
 
 		 241 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  74.11 
 
 		 230 aa  338  7e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0721  ribosomal protein S3  64.6 
 
 		 226 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  62.56 
 
 		 219 aa  288  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  64.29 
 
 		 219 aa  285  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  62.74 
 
 		 221 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  59.24 
 
 		 211 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  58.77 
 
 		 211 aa  277  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  61.32 
 
 		 220 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  56.19 
 
 		 224 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 210 aa  271  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  58.85 
 
 		 229 aa  271  8.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 218 aa  271  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  58.74 
 
 		 278 aa  271  9e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  57.08 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  55.31 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  55.31 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  60.65 
 
 		 220 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  59.24 
 
 		 218 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  59.91 
 
 		 226 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  60.66 
 
 		 217 aa  270  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 210 aa  269  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 223 aa  268  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  60.66 
 
 		 217 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  55.36 
 
 		 223 aa  266  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  58.57 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 217 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 223 aa  264  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  56.87 
 
 		 219 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  51.74 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  59.81 
 
 		 222 aa  262  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1019  30S ribosomal protein S3  50.19 
 
 		 287 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1046  30S ribosomal protein S3  50.19 
 
 		 287 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1036  30S ribosomal protein S3  50.19 
 
 		 287 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  55.71 
 
 		 210 aa  262  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  55.61 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  59.33 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  56.59 
 
 		 288 aa  261  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  57.07 
 
 		 270 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  50.39 
 
 		 288 aa  261  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  50.39 
 
 		 288 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 235 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  57.6 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  55.86 
 
 		 228 aa  260  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 232 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 218 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  55.34 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0457  30S ribosomal protein S3  57.87 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  55.83 
 
 		 341 aa  259  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  55.61 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0480  30S ribosomal protein S3  58.33 
 
 		 278 aa  259  4e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 252 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 232 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 233 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  55.2 
 
 		 268 aa  258  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  52.23 
 
 		 282 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  58.14 
 
 		 221 aa  258  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  55.77 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  56.87 
 
 		 258 aa  258  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 275 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  50.98 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_423  ribosomal protein S3  57.87 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1129  ribosomal protein S3  55.83 
 
 		 279 aa  258  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 272 aa  258  9e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 236 aa  258  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2969  SSU ribosomal protein S3P  53.19 
 
 		 277 aa  258  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.530475  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  54.85 
 
 		 315 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  54.13 
 
 		 221 aa  258  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1311  30S ribosomal protein S3  50.19 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  55.36 
 
 		 225 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  53.48 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17100  SSU ribosomal protein S3P  52.89 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0525637  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  55.56 
 
 		 210 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  56.16 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 231 aa  255  6e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  55.31 
 
 		 228 aa  255  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  55 
 
 		 233 aa  254  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  53.52 
 
 		 213 aa  254  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  56.88 
 
 		 395 aa  254  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  53.99 
 
 		 213 aa  254  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2681  ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 276 aa  254  8e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>