More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2613 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2613  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00358822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  90 
 
 		 250 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  62.82 
 
 		 248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  54.67 
 
 		 219 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  56.46 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  53.99 
 
 		 218 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  53.99 
 
 		 218 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  50.84 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  48.76 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  50.43 
 
 		 231 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  50.43 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  49.59 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  50.43 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  49.17 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  49.17 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 231 aa  225  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  47.89 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  48.75 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  49.53 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  49.53 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  50.66 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  46.67 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  48.72 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  49.77 
 
 		 211 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 211 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  49.53 
 
 		 210 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0209  30S ribosomal protein S3  47.23 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  49.77 
 
 		 211 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  49.77 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  47.6 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  47.6 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  47.6 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  48.73 
 
 		 256 aa  218  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  47.86 
 
 		 232 aa  219  5e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  51.63 
 
 		 227 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  49.33 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  48.9 
 
 		 252 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  47.6 
 
 		 232 aa  218  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  51.56 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0262  30S ribosomal protein S3  46.69 
 
 		 301 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  51.33 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  48.82 
 
 		 210 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  46.61 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1869  30S ribosomal protein S3  48.09 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.437759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1698  30S ribosomal protein S3  48.09 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  46.41 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  47.86 
 
 		 232 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  48.09 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  51.64 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  48.47 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  48.47 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  48.47 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  49.3 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 241 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  48.33 
 
 		 222 aa  215  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  50.48 
 
 		 216 aa  215  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 220 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  47.46 
 
 		 233 aa  215  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  45.53 
 
 		 236 aa  214  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  49.76 
 
 		 226 aa  215  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  47.39 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0220  ribosomal protein S3  50.72 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  51.6 
 
 		 224 aa  214  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  48.73 
 
 		 229 aa  214  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  49.76 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 214 aa  214  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>