More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0231 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  73.64 
 
 		 221 aa  349  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  74.65 
 
 		 220 aa  345  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  73.97 
 
 		 220 aa  343  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  74.31 
 
 		 219 aa  340  8e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  67.27 
 
 		 219 aa  317  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  68.9 
 
 		 226 aa  317  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  68.42 
 
 		 222 aa  313  9e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  66.19 
 
 		 214 aa  313  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  69.63 
 
 		 222 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  67.42 
 
 		 221 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  67.58 
 
 		 218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  67.58 
 
 		 218 aa  305  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  66.82 
 
 		 226 aa  300  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  63.18 
 
 		 219 aa  295  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  64.59 
 
 		 211 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  63.3 
 
 		 217 aa  292  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  63.3 
 
 		 217 aa  292  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 210 aa  292  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  62.39 
 
 		 217 aa  290  9e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  66.36 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 210 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  61.43 
 
 		 229 aa  289  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  61.97 
 
 		 224 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  61.97 
 
 		 224 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  62.27 
 
 		 219 aa  287  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  61.82 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  62.84 
 
 		 217 aa  287  8e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  61.82 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  61.82 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  61.82 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  61.82 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  61.82 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  61.82 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  61.82 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  61.82 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 223 aa  286  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  61.79 
 
 		 224 aa  286  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  63.51 
 
 		 221 aa  286  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  63.3 
 
 		 217 aa  286  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  61.5 
 
 		 224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  61.61 
 
 		 211 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  61.61 
 
 		 211 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 210 aa  285  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  60.38 
 
 		 222 aa  284  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  60.38 
 
 		 222 aa  284  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 240 aa  284  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 236 aa  282  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  62.56 
 
 		 222 aa  281  7.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  61.54 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  62.04 
 
 		 217 aa  278  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 244 aa  277  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  61.29 
 
 		 238 aa  277  9e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  56.68 
 
 		 219 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  59.52 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  61.14 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  61.54 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 238 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 238 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  61.79 
 
 		 223 aa  274  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  60.19 
 
 		 275 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 225 aa  273  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  62.2 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 220 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 228 aa  272  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  58.56 
 
 		 236 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  58.56 
 
 		 236 aa  271  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  58.56 
 
 		 236 aa  271  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 232 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  60.93 
 
 		 233 aa  270  9e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  61.54 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  60.93 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  60.93 
 
 		 233 aa  269  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  61.54 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  60.93 
 
 		 233 aa  269  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 237 aa  269  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 315 aa  269  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 229 aa  269  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  57.4 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  61.54 
 
 		 236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 231 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 232 aa  268  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 232 aa  268  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 232 aa  268  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>