More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2327 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  71.56 
 
 		 219 aa  327  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  73.21 
 
 		 219 aa  327  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  70.42 
 
 		 221 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  67.61 
 
 		 220 aa  308  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  66.36 
 
 		 218 aa  307  6.999999999999999e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  65.26 
 
 		 226 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  65.09 
 
 		 218 aa  299  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  63.98 
 
 		 211 aa  298  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  63.21 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  61.68 
 
 		 214 aa  295  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 220 aa  295  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  63.03 
 
 		 211 aa  294  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  63.03 
 
 		 211 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 210 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 211 aa  291  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  59.33 
 
 		 229 aa  291  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  63.08 
 
 		 221 aa  291  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  60.65 
 
 		 219 aa  290  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 210 aa  290  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  61.72 
 
 		 210 aa  289  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  63.85 
 
 		 222 aa  289  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 210 aa  289  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  58.8 
 
 		 222 aa  288  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 219 aa  288  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  63.03 
 
 		 222 aa  288  7e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  61.01 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  61.01 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  59.52 
 
 		 224 aa  284  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  59.52 
 
 		 224 aa  284  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  59.52 
 
 		 224 aa  284  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  58.93 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  59.26 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  58.6 
 
 		 224 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  57.71 
 
 		 245 aa  276  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 217 aa  275  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 217 aa  275  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  58.77 
 
 		 217 aa  274  8e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 217 aa  274  9e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  57.8 
 
 		 223 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  60.39 
 
 		 210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  59.91 
 
 		 243 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 217 aa  271  5.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  59.45 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  55.5 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  55.71 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 233 aa  269  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  58.53 
 
 		 237 aa  268  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 221 aa  268  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 213 aa  268  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 217 aa  267  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  56.76 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  56.5 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  56.95 
 
 		 239 aa  265  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  56.46 
 
 		 213 aa  265  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  57.87 
 
 		 223 aa  264  8e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  57.59 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  57.59 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  57.59 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  56.46 
 
 		 212 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  57.6 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  58.29 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  57.6 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  57.6 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  55.91 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 213 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  55.91 
 
 		 220 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  54.34 
 
 		 223 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  58.06 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  53.78 
 
 		 227 aa  262  3e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  53.78 
 
 		 227 aa  262  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 226 aa  262  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  56.82 
 
 		 228 aa  262  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0085  30S ribosomal protein S3  57.49 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0561951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 216 aa  262  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  57.87 
 
 		 225 aa  262  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1759  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 212 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.341094  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 275 aa  261  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  57.87 
 
 		 225 aa  260  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  55.41 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  55.02 
 
 		 395 aa  260  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  55.41 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  55.41 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  55.41 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  57.01 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  55.2 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>